RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 USH1GQ495M9 461 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 KRT40Q6A162 431 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 FEM1BQ9UK73 627 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 RGMBQ6NW40 437 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 MTMR8Q96EF0 704 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 SLF1Q9BQI6 1058 aa21.44■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 H3BQV1 296 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 CLCN1P35523 988 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 SNAPC2Q13487 334 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 IFFO2Q5TF58 517 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 CPXCR1Q8N123 301 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 GPT2Q8TD30 523 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 OXER1Q8TDS5 423 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB5O15062 677 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 CCL15Q16663 113 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 PTPN18Q99952 460 aa21.43■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.42■■□□□ 1.02
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PRRT1-201ENST00000211413 KIF28PB7ZC32 967 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 STXBP3O00186 592 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 SMARCA1P28370 1054 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 FSTL1Q12841 308 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.42■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L15C9J2P7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L11C9JVI0 530 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L18D6R9N7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L22D6RA61 530 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L19D6RCP7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L20D6RJB6 530 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L24Q0WX57 530 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 UNCXA6NJT0 531 aa21.41■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 BTBD19C9JJ37 291 aa21.41■■□□□ 1.02
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PRRT1-201ENST00000211413 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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PRRT1-201ENST00000211413 ZNF536O15090 1300 aa21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 DSG3P32926 999 aa21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 NR5A1Q13285 461 aa21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 COG2Q14746 738 aa21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 NPY5RQ15761 445 aa21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 BARHL2Q9NY43 387 aa21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.4■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 BTBD18B2RXH4 712 aa21.39■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 VWA5AO00534 786 aa21.39■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 MBD3O95983 291 aa21.39■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 NAPAP54920 295 aa21.39■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 WASF1Q92558 559 aa21.39■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.39■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 PLA2G6O60733 806 aa21.39■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 PDCP20941 246 aa21.39■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 GTF2A2P52657 109 aa21.39■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 NLRP5P59047 1200 aa21.39■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 FBXO11Q86XK2 927 aa21.39■■□□□ 1.01
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PRRT1-201ENST00000211413 SLC10A3P09131 477 aa21.38■■□□□ 1.01
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PRRT1-201ENST00000211413 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 KIF3AQ9Y496 699 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 RIPK3Q9Y572 518 aa21.38■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 PDHXO00330 501 aa21.37■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 AOC2O75106 756 aa21.37■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 MMP1P03956 469 aa21.37■■□□□ 1.01
PRRT1-201ENST00000211413 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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