RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC16A2P36021 539 aa27.2■■□□□ 1.95
RPUSD1-201ENST00000007264 SLFN13Q68D06 897 aa27.2■■□□□ 1.95
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.2■■□□□ 1.95
RPUSD1-201ENST00000007264 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
RPUSD1-201ENST00000007264 IKBKBO14920 756 aa27.2■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 IL17AQ16552 155 aa27.2■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27.2■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 IQUBQ8NA54 791 aa27.2■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC25BP30305 580 aa27.19■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 LETM2Q2VYF4 491 aa27.19■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.19■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 NEK8Q86SG6 692 aa27.19■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIML1Q8N9V2 468 aa27.19■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa27.19■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.19■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 MAN1B1Q9UKM7 699 aa27.19■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 ZBTB5O15062 677 aa27.18■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM151AQ8WW52 585 aa27.18■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 JDP2Q8WYK2 163 aa27.18■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 DACH1Q9UI36 760 aa27.18■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 AFMP43652 599 aa27.18■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 VEZTQ9HBM0 779 aa27.18■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 USP17L10C9JJH3 530 aa27.17■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 GH2P01242 217 aa27.17■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 SPDYE2Q495Y8 402 aa27.17■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 TBCKQ8TEA7 893 aa27.17■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 PAGE5Q96GU1 130 aa27.17■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 MYO1BO43795 1136 aa27.17■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 PRPHP41219 470 aa27.17■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 MYL5Q02045 173 aa27.17■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 CXCL9Q07325 125 aa27.16■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM60Q9H2L4 133 aa27.16■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.16■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 MLKLQ8NB16 471 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM260Q9NX78 707 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 F5H6K3 240 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 NEMFO60524 1076 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 KLRC3Q07444 240 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 MORC3Q14149 939 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 NCAPHQ15003 741 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 CIAPIN1Q6FI81 312 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 RASSF8Q8NHQ8 419 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 CUL5Q93034 780 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 MTMR8Q96EF0 704 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa27.15■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 OR52Z1P0C646 297 aa27.14■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 MTMR14Q8NCE2 650 aa27.14■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 SPATA20Q8TB22 786 aa27.14■■□□□ 1.94
RPUSD1-201ENST00000007264 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 FKBP1CQ5VVH2 108 aa27.13■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC186Q7Z3E2 898 aa27.13■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 BMP6P22004 513 aa27.13■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 PTGS1P23219 599 aa27.13■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 UBA7P41226 1012 aa27.13■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 E2F4Q16254 413 aa27.13■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 IKQ13123 557 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 GMCL1Q96IK5 515 aa27.12■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 CNTNAP1P78357 1384 aa27.12■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 STAT6P42226 847 aa27.12■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 GSDMAQ96QA5 445 aa27.12■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 NDUFB10O96000 172 aa27.11■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC25AP30304 524 aa27.11■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 TNIP1Q15025 636 aa27.11■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa27.11■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 JAG1P78504 1218 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 DPYDQ12882 1025 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 KARSQ15046 597 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 QRICH1Q2TAL8 776 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 PDXDC2PQ6P474 469 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 AK8Q96MA6 479 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 NRBP1Q9UHY1 535 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 TNNI2P48788 182 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM83AQ86UY5 434 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 DISC1Q9NRI5 854 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa27.1■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 IFNKQ9P0W0 207 aa27.09■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27.09■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 BMP3P12645 472 aa27.09■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 CASP1P29466 404 aa27.09■■□□□ 1.93
RPUSD1-201ENST00000007264 UBE2SQ16763 222 aa27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms