RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tfap4Q9JIZ5 338 aa26.26■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Armc2Q3URY6 854 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nsrp1Q5NCR9 542 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ifi35Q9D8C4 286 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa26.25■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Usp49Q6P9L4 685 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cep85Q8BMK0 761 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tubgcp2Q921G8 905 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10134F6ZQC6 126 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21969J3QJZ1 289 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ptgs1P22437 602 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wnt7aP24383 349 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sap30bpQ02614 308 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hdac4Q6NZM9 1076 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Angel2Q8K1C0 544 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Usp31E9Q6Y8 1344 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tbc1d2B1AVH7 922 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nfil3O08750 462 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Copb2O55029 905 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prkg1P0C605 671 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abhd15Q5F2F2 459 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spata21Q8BHW6 681 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nod2Q8K3Z0 1020 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cd2apQ9JLQ0 637 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Btn2a2A4QPC6 514 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kctd1Q5M956 257 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cep128Q8BI22 1102 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccz1Q8C1Y8 480 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Il21rQ9JHX3 529 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Psmd10Q9Z2X2 231 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdkn1cP49919 348 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tll1Q62381 1013 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Grm4Q68EF4 912 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Riox2Q8CD15 465 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 A0A0U1RNP2 1173 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Wdr78E9PYY5 807 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5624F6ZZG8 207 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lilrb3P97484 841 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Brms1Q99N20 246 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hip1rQ9JKY5 1068 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mboat4P0C7A3 435 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rasa2P58069 847 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Nbr1P97432 988 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gjb4Q02738 266 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 C87499Q3UX49 493 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PRAG1Q571I4 1179 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ms4a5Q810P8 197 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc94Q9D6J3 314 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 UtrnE9Q6R7 3430 aa26.2■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tdo2P48776 406 aa26.2■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc9a1Q61165 820 aa26.2■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Galnt17Q7TT15 598 aa26.2■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa26.2■■□□□ 1.79
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Frmpd4A2AFR3 1320 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 CluhQ5SW19 1315 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sdc2P43407 202 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adgre1Q61549 931 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Clca4aQ6Q473 924 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ubxn8Q9QZ49 277 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gucy1a2F8VQK3 730 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Has3O08650 554 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Anks1aP59672 1150 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kcnd1Q03719 651 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tshz1Q5DTH5 1084 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cnnm4Q69ZF7 771 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Garem2Q6PAJ3 880 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gmcl1Q920G9 524 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Inpp4aQ9EPW0 939 aa26.19■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Myh7bA2AQP0 1941 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdc27A2A6Q5 825 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc4a9E9PUP3 929 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf697Q569E7 569 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tmem60Q8K174 133 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Scrn1Q9CZC8 414 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5114W4VSN8 858 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 ThbdP15306 577 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Aco1P28271 889 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdh15P33146 784 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp341Q6PGC9 846 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnai2A2AC93 623 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 LtkP08923 888 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rhpn1Q61085 643 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PdgfdQ925I7 370 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 LpxnQ99N69 386 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 MycnP03966 462 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gcnt1Q09324 428 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gga3Q8BMI3 718 aa26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.6 ms