Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
Cdh15P33146 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Cdh15P33146 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Cdh15P33146 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Cdh15P33146 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cdh15P33146 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cdh15P33146 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Cdh15P33146 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Cdh15P33146 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cdh15P33146 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Cdh15P33146 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Cdh15P33146 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cdh15P33146 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Cdh15P33146 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cdh15P33146 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cdh15P33146 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cdh15P33146 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Cdh15P33146 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cdh15P33146 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Cdh15P33146 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cdh15P33146 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Cdh15P33146 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cdh15P33146 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Cdh15P33146 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Cdh15P33146 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cdh15P33146 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cdh15P33146 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Cdh15P33146 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cdh15P33146 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cdh15P33146 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cdh15P33146 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cdh15P33146 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdh15P33146 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdh15P33146 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdh15P33146 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cdh15P33146 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdh15P33146 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdh15P33146 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdh15P33146 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdh15P33146 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cdh15P33146 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cdh15P33146 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cdh15P33146 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdh15P33146 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdh15P33146 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cdh15P33146 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cdh15P33146 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cdh15P33146 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Cdh15P33146 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cdh15P33146 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cdh15P33146 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdh15P33146 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cdh15P33146 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cdh15P33146 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cdh15P33146 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdh15P33146 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cdh15P33146 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cdh15P33146 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cdh15P33146 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cdh15P33146 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cdh15P33146 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cdh15P33146 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cdh15P33146 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdh15P33146 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Cdh15P33146 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdh15P33146 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Cdh15P33146 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cdh15P33146 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdh15P33146 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Cdh15P33146 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdh15P33146 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cdh15P33146 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cdh15P33146 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdh15P33146 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Cdh15P33146 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cdh15P33146 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Cdh15P33146 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cdh15P33146 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cdh15P33146 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cdh15P33146 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Cdh15P33146 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cdh15P33146 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cdh15P33146 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Cdh15P33146 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cdh15P33146 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cdh15P33146 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdh15P33146 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdh15P33146 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdh15P33146 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cdh15P33146 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cdh15P33146 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cdh15P33146 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cdh15P33146 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cdh15P33146 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cdh15P33146 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Cdh15P33146 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Cdh15P33146 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Cdh15P33146 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Cdh15P33146 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cdh15P33146 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms