RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RDS3	YPR094W	LHS1	P36016	881 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	MIA40	P36046	403 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	GEX2	P36173	615 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	YLF2	P38746	405 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	ECM10	P39987	644 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	REE1	P40893	198 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	YFR020W	P43600	232 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	NIT2	P47016	307 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PMT3	P47190	753 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SLD3	P53135	668 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	YMR027W	Q04371	470 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	TAF7	Q05021	590 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	ATG26	Q06321	1198 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	IES4	Q08561	116 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CTF3	Q12748	733 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	NUP145	P49687	1317 aa		0.27	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SNF3	P10870	884 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PHO3	P24031	467 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	UBA4	P38820	440 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SWD1	P39706	426 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	MRX1	P40050	688 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SHO1	P40073	367 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SWP82	P43554	623 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	YGL082W	P53155	381 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	HST1	P53685	503 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CRN1	Q06440	651 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	ATG23	Q06671	453 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	VAM6	Q07468	1049 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	YOL057W	Q08225	711 aa		0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CHS1	P08004	1131 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PRB1	P09232	635 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PGS1	P25578	521 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	MRP4	P32902	394 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PIM1	P36775	1133 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	TAF5	P38129	798 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	RCK2	P38623	610 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	HAT2	P39984	401 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	ALG8	P40351	577 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	TMA108	P40462	946 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CAB2	P40506	365 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	OSW7	P43611	510 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	YGR237C	P50089	785 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	ALG12	P53730	551 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	INN1	P53901	409 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	RSM28	Q03430	361 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	RRN11	Q04712	507 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	YPR091C	Q06833	770 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SSK1	Q07084	712 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PEX15	Q08215	383 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	TRE2	Q08693	809 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	NUR1	Q12066	484 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SLX4	Q12098	748 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PRM7	Q12459	698 aa		0.25	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PET122	P10355	254 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	HEM15	P16622	393 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SNC1	P31109	117 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	VID24	P38263	362 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CHS6	P40955	746 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CTF18	P49956	741 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	NNF2	P53253	936 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	YPL014W	Q02606	381 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SYO1	Q07395	620 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SWT1	Q12104	458 aa		0.24	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SAL1	D6W196	494 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	APE1	P14904	514 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	PET123	P17558	318 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	RIT1	P23796	513 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CPR4	P25334	318 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	SEF1	P34228	1148 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CHK1	P38147	527 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	APM3	P38153	483 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	ANS1	P38832	159 aa		0.23	□□□□□ -2.37
RDS3	YPR094W	CSM2	P40465	213 aa		0.23	□□□□□ -2.37

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