RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558258.1

AC009558.2-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009558.2, Length 396 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009558.2-201ENST00000558258 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.34□□□□□ -1.23
AC009558.2-201ENST00000558258 ARMC5Q96C12 935 aa7.34□□□□□ -1.23
AC009558.2-201ENST00000558258 LGR4Q9BXB1 951 aa7.34□□□□□ -1.23
AC009558.2-201ENST00000558258 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.34□□□□□ -1.23
AC009558.2-201ENST00000558258 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.34□□□□□ -1.23
AC009558.2-201ENST00000558258 WHRNQ9P202 907 aa7.34□□□□□ -1.23
AC009558.2-201ENST00000558258 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.34□□□□□ -1.23
AC009558.2-201ENST00000558258 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.33□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM82A0PJX8 343 aa7.33□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ITGA4P13612 1032 aa7.33□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 FXNQ16595 210 aa7.33□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.33□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.33□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 TCFL5Q9UL49 500 aa7.33□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 SUSD5O60279 629 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 FKTNO75072 461 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 DDAH1O94760 285 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 SYPP08247 313 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 SERINC3Q13530 473 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ZPBP2Q6X784 338 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 EBF1Q9UH73 591 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.32□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF205O95201 554 aa7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 BMP8BP34820 402 aa7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 GBP3Q9H0R5 595 aa7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.31□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 TBX1O43435 398 aa7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 RBL2Q08999 1139 aa7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 PPP2R5DQ14738 602 aa7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 TCEAL1Q15170 157 aa7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 RTP2Q5QGT7 225 aa7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 GSNP06396 782 aa7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 NBPF4Q96M43 638 aa7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.29□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 A0A087WZG4 1122 aa7.28□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 IFNGR1P15260 489 aa7.28□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 VAV1P15498 845 aa7.28□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.28□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 SP110Q9HB58 689 aa7.28□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.28□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.28□□□□□ -1.24
AC009558.2-201ENST00000558258 PPM1BO75688 479 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 PAPLNO95428 1278 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 EFEMP2O95967 443 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 CD3EP07766 207 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 HK2P52789 917 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 ERVFC1P60507 584 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 RASA3Q14644 834 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 DRC1Q96MC2 740 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.27□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 STXBP3O00186 592 aa7.26□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 VAMP4O75379 141 aa7.26□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.26□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.26□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 BVESQ8NE79 360 aa7.26□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.26□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 APBA2Q99767 749 aa7.26□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.26□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.25□□□□□ -1.25
AC009558.2-201ENST00000558258 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms