RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5.76□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 PIK3R4Q99570 1358 aa5.76□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 USP19O94966 1318 aa5.75□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 TECPR2O15040 1411 aa5.75□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 KNDC1Q76NI1 1749 aa5.75□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.75□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 ASMTLO95671 621 aa5.75□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 ECEL1O95672 775 aa5.75□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 IGHA1P01876 353 aa5.75□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 TRIM27P14373 513 aa5.75□□□□□ -1.49
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CYCSP28-201ENST00000534284 SQSTM1Q13501 440 aa5.75□□□□□ -1.49
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CYCSP28-201ENST00000534284 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.75□□□□□ -1.49
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CYCSP28-201ENST00000534284 ITPRIPQ8IWB1 547 aa5.75□□□□□ -1.49
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CYCSP28-201ENST00000534284 CHMP5Q9NZZ3 219 aa5.75□□□□□ -1.49
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CYCSP28-201ENST00000534284 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.75□□□□□ -1.49
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CYCSP28-201ENST00000534284 PTCH1Q13635 1447 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 MYO5BQ9ULV0 1848 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 GFRA2O00451 464 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 FSCN2O14926 492 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 RAPGEF3O95398 923 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 ITGB2P05107 769 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 PGRP06401 933 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 RAG1P15918 1043 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 LIG1P18858 919 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 BMP2KLQ5H9B9 411 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 UNC5AQ6ZN44 842 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 HSCBQ8IWL3 235 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 WNT8BQ93098 351 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 SNX21Q969T3 373 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 CDK19Q9BWU1 502 aa5.74□□□□□ -1.49
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CYCSP28-201ENST00000534284 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 A2ML1A8K2U0 1454 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 LRRC7Q96NW7 1537 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 YEATS2Q9ULM3 1422 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 RIMS2Q9UQ26 1411 aa5.74□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.73□□□□□ -1.49
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CYCSP28-201ENST00000534284 LILRB5O75023 590 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 SLFN14P0C7P3 912 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 CNGA1P29973 690 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 NLRP12P59046 1061 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 NUCB1Q02818 461 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 GNPTABQ3T906 1256 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 C12orf40Q86WS4 652 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 ATG4CQ96DT6 458 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.73□□□□□ -1.49
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CYCSP28-201ENST00000534284 CPS1P31327 1500 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 PRR36Q9H6K5 1346 aa5.73□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 IQCA1LA6NCM1 817 aa5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 GRK4P32298 578 aa5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC7A5Q01650 507 aa5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 TKFCQ3LXA3 575 aa5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 CHD1LQ86WJ1 897 aa5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
CYCSP28-201ENST00000534284 SYNPOQ8N3V7 929 aa5.72□□□□□ -1.49
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