RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 LIN7BQ9HAP6 207 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF7Q9UBF6 113 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCDC2CA8MYV0 355 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXS1O43638 330 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASGR2P07307 311 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAKP20794 623 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 TUBA3CQ13748 450 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR16Q569H4 304 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PKN3Q6P5Z2 889 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 TUBA3EQ6PEY2 450 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDH24Q86UP0 819 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 C12orf40Q86WS4 652 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00482Q8N8I6 264 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCT2Q8NC54 265 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 EDAQ92838 391 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNB2Q92953 911 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX11Q96FC9 970 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARXQ96QS3 562 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADOQ96SZ5 270 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 GDPD2Q9HCC8 539 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPATCH2Q9NW75 528 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLAIN2Q9P270 581 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRP12Q9Y561 859 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHISA3A0PJX4 238 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBSLP0DN79 551 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL13P26373 211 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBSP35520 551 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 LAPTM5Q13571 262 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC14A2Q15849 920 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP43Q70EL4 1123 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAJB8Q8NHS0 232 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACSL6Q9UKU0 697 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 FADS2P1A8MWK0 482 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM38O00635 465 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP9BO43861 1147 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHACTR2O75167 634 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYP7A1P22680 504 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCKBRP32239 447 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 WASP42768 502 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP2CBP62714 309 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP2CAP67775 309 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 FSTL1Q12841 308 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR31Q5SQ13 230 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLFN13Q68D06 897 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 MCTP2Q6DN12 878 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 DLK2Q6UY11 383 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6ZSN1 163 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTLL7Q6ZT98 887 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 HDXQ7Z353 690 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNX29Q8TEQ0 813 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLIP3Q96DZ5 547 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAN1Q9Y2M0 1017 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CST3P01034 146 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDGFAP04085 211 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCAM1P13591 858 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 THBS2P35442 1172 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARL4AP40617 200 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABL2P42684 1182 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 RTP1P59025 263 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP10-1P60331 282 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 NR1I3Q14994 352 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZPBP2Q6X784 338 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDC37L1Q7L3B6 337 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKHH3Q7Z736 793 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLCO6A1Q86UG4 719 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM124AQ86V42 546 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 EDEM1Q92611 657 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB8AQ96BR9 441 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIOX1Q9H6W3 641 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCB6Q9NP58 842 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 STIM2Q9P246 746 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBLN5Q9UBX5 448 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 COX11Q9Y6N1 276 aa1.1□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZAR1LA6NP61 321 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 DBHP09172 617 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRKCAP17252 672 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLK3P49761 638 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 POU4F1Q01851 419 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXF2Q12947 444 aa1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms