RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 ITPKAP23677 461 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 MTX1Q13505 466 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 GRIK5Q16478 980 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 KANK3Q6NY19 840 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 SSH3Q8TE77 659 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 CRELD1Q96HD1 420 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.66□□□□□ -1.184e-43■■■■■ 44.1
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 WIPF1O43516 503 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 CSF1RP07333 972 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 GNAI3P08754 354 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 BAG6P46379 1132 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 GRIA4P48058 902 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 MSL1Q68DK7 614 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 SMC5Q8IY18 1101 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 BACH2Q9BYV9 841 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 ADAM19Q9H013 955 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 RBSNQ9H1K0 784 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 DCTPP1Q9H773 170 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-212ENST00000491266 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 CDHR2Q9BYE9 1310 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 ALBP02768 609 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 USP17L7P0C7H9 530 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 ALAS2P22557 587 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 RFC4P35249 363 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 WHAMMQ8TF30 809 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 BTBD6Q96KE9 485 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 C4AP0C0L4 1744 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 SCN7AQ01118 1682 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 METTL12A8MUP2 240 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.63□□□□□ -1.198e-15■■■■□ 24
RABGGTB-212ENST00000491266 GSTT1P30711 240 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 PARP10Q53GL7 1025 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 CHSY3Q70JA7 882 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 SOX13Q9UN79 622 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 BCORQ6W2J9 1755 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 CACNA1FO60840 1977 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A096LPE4 126 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A1W2PPZ6 126 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 SASH1O94885 1247 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 CEP135Q66GS9 1140 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF576Q9H609 170 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGGTB-212ENST00000491266 GREM2Q9H772 168 aa7.62□□□□□ -1.19
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