RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CUL4AQ13619 759 aa34.37■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 FAM43AQ8N2R8 423 aa34.37■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 GTF3C6Q969F1 213 aa34.37■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 GNAQP50148 359 aa34.37■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP34.37■■■■□ 3.096e-7■■□□□ 11.4
ECHS1-201ENST00000368547 PDHXO00330 501 aa34.36■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 TMTC3Q6ZXV5 915 aa34.36■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 CHURC1Q8WUH1 139 aa34.36■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP34.35■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 PLA2G6O60733 806 aa34.35■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 BTNL9Q6UXG8 535 aa34.35■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF11Q86T75 865 aa34.35■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 FAM160B2Q86V87 743 aa34.35■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 TM4SF4P48230 202 aa34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 ST3GAL1Q11201 340 aa34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 IFNL1Q8IU54 200 aa34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC82Q8N4S0 544 aa34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 KIFC2Q96AC6 838 aa34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 SLF1Q9BQI6 1058 aa34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 LZTS2Q9BRK4 669 aa34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa34.34■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 COG2Q14746 738 aa34.33■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC83Q8IWF9 413 aa34.33■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 CPLX1O14810 134 aa34.33■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 OSBPP22059 807 aa34.33■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 DDIT3P35638 169 aa34.33■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35G1Q2M3R5 365 aa34.33■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 SYDE2Q5VT97 1194 aa34.33■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa34.33■■■■□ 3.09
ECHS1-201ENST00000368547 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 MAP2K2P36507 400 aa34.32■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 PRR12Q9ULL5 1215 aa34.32■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 THSD7BQ9C0I4 1608 aa34.31■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 CYTH3O43739 400 aa34.31■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 NTRK3Q16288 839 aa34.31■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRF4Q8IZF3 695 aa34.31■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 VAT1LQ9HCJ6 419 aa34.31■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 PNMA3Q9UL41 463 aa34.31■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 DSG3P32926 999 aa34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 SPZ1Q9BXG8 430 aa34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 HOXC10Q9NYD6 342 aa34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 CYP2C8P10632 490 aa34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 SMARCA1P28370 1054 aa34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 FUT2Q10981 343 aa34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 ATG4CQ96DT6 458 aa34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 RIOX1Q9H6W3 641 aa34.3■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
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ECHS1-201ENST00000368547 JMJD4Q9H9V9 463 aa34.29■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 MYPNQ86TC9 1320 aa34.28■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa34.28■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 PPFIA3O75145 1194 aa34.28■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 IFNAR1P17181 557 aa34.28■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 PHKBQ93100 1093 aa34.28■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 DTNBO60941 627 aa34.27■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 CTDNEP1O95476 244 aa34.27■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 HERVK_113P62684 666 aa34.27■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 SNAP25P60880 206 aa34.26■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 PIBF1Q8WXW3 757 aa34.26■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 CHMP5Q9NZZ3 219 aa34.26■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 MYH6P13533 1939 aa34.26■■■■□ 3.08
ECHS1-201ENST00000368547 A0A0G2JMZ2 1700 aa34.26■■■■□ 3.07
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ECHS1-201ENST00000368547 CDKL5O76039 1030 aa34.25■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 HOMER1Q86YM7 354 aa34.25■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 PIGSQ96S52 555 aa34.25■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
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ECHS1-201ENST00000368547 MTMR8Q96EF0 704 aa34.24■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 SLC26A6Q9BXS9 759 aa34.24■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa34.23■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 POTEEQ6S8J3 1075 aa34.23■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 LBX2Q6XYB7 198 aa34.23■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa34.23■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 V9GY48 417 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 ZBED4O75132 1171 aa34.22■■■■□ 3.07
ECHS1-201ENST00000368547 FDX1P10109 184 aa34.22■■■■□ 3.07
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