RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 XBP1P17861 261 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXA4-201ENST00000360046 DGKZQ13574 1117 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXA4-201ENST00000360046 KRT40Q6A162 431 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXA4-201ENST00000360046 LPAR1Q92633 364 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXA4-201ENST00000360046 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXA4-201ENST00000360046 TOMM70O94826 608 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 OTUD5Q96G74 571 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 STAT2P52630 851 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 ERO1BQ86YB8 467 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.26■■□□□ 1.63
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HOXA4-201ENST00000360046 HMGCS2P54868 508 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 PPATQ06203 517 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 PASKQ96RG2 1323 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 C19orf81C9J6K1 198 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 VCAM1P19320 739 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 RGS22Q8NE09 1264 aa25.23■■□□□ 1.63
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HOXA4-201ENST00000360046 UNCXA6NJT0 531 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.23■■□□□ 1.63
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HOXA4-201ENST00000360046 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 CHURC1Q8WUH1 139 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 FEM1BQ9UK73 627 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 PTPRFP10586 1907 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 IRF6O14896 467 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB5O15062 677 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 MMP1P03956 469 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 HUNKP57058 714 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 RESTQ13127 1097 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 FAM160B2Q86V87 743 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 KIFC2Q96AC6 838 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 SHISA4Q96DD7 197 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 BARHL2Q9NY43 387 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 MTMR8Q96EF0 704 aa25.2■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.2■■□□□ 1.63
HOXA4-201ENST00000360046 STXBP3O00186 592 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 SNAP25P60880 206 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 PPIL2Q13356 520 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 C12orf42Q96LP6 360 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 GBP4Q96PP9 640 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.2■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 PLA2G6O60733 806 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 NAPAP54920 295 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 NLRP5P59047 1200 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 KIF28PB7ZC32 967 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 CXCL11O14625 94 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 FLOT1O75955 427 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 COA7Q96BR5 231 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 MYH15Q9Y2K3 1946 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 BTBD18B2RXH4 712 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 CALML3P27482 149 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 KRT2P35908 639 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 GJA5P36382 358 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 FSTL1Q12841 308 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 WNK4Q96J92 1243 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 PARP14Q460N5 1801 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXA4-201ENST00000360046 BRAPQ7Z569 592 aa25.15■■□□□ 1.62
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