RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
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PDE4D-204ENST00000358923 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 TPM3P06753 285 aa20.38■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 XBP1P17861 261 aa20.38■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 CMA1P23946 247 aa20.38■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.38■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 TNFRSF25Q93038 417 aa20.38■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 A0A087X0B3 334 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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PDE4D-204ENST00000358923 SEPT2Q15019 361 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC93Q567U6 631 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 EFCC1Q9HA90 598 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 A0A1W2PQ27 194 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 A0A1W2PQ64 194 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 A0A1W2PQD8 194 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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PDE4D-204ENST00000358923 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 SMTNL1A8MU46 457 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 FAM193AP78312 1265 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 INF2Q27J81 1249 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 YY1AP1Q9H869 796 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.37■□□□□ 0.85
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PDE4D-204ENST00000358923 PTGDRQ13258 359 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM260Q9NX78 707 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM75PA6NK02 468 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 PPP2R5BQ15173 497 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 PTPN21Q16825 1174 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 ANKS1AQ92625 1134 aa20.36■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 PRR29P0C7W0 189 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 HLA-DOAP06340 250 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 IL17AQ16552 155 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC96Q2M329 555 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 RESP18Q5W5W9 173 aa20.35■□□□□ 0.85
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PDE4D-204ENST00000358923 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.35■□□□□ 0.85
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PDE4D-204ENST00000358923 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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PDE4D-204ENST00000358923 CSRNP1Q96S65 589 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 SERTAD1Q9UHV2 236 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 PP2D1A8MPX8 630 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 STXBP3O00186 592 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 PPP6R2O75170 966 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 BLIDQ8IZY5 108 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 RASSF7Q02833 373 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA1468Q9P260 1216 aa20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 PTPREP23469 700 aa20.33■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 CXCL9Q07325 125 aa20.33■□□□□ 0.85
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.33■□□□□ 0.85
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PDE4D-204ENST00000358923 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.33■□□□□ 0.85
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PDE4D-204ENST00000358923 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.33■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
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PDE4D-204ENST00000358923 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.33■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 DHX58Q96C10 678 aa20.33■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
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PDE4D-204ENST00000358923 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.33■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 HPSEQ9Y251 543 aa20.33■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.33■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L10C9JJH3 530 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 GH2P01242 217 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 CNNM3Q8NE01 707 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 FZD1Q9UP38 647 aa20.32■□□□□ 0.84
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