RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)D

tK(UUU)D, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)D, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)DtK(UUU)D URA7P28274 579 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D RIM1P32445 135 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D AIM26P32858 118 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D NFU1P32860 256 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D DOM34P33309 386 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D YKL100CP34248 587 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D NTR2P36118 322 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D LDB7P38210 180 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D TRM7P38238 310 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D OCA5P38738 679 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D WSC4P38739 605 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D SEO1P39709 593 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D HAT2P39984 401 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D SSU1P41930 458 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D ZIM17P42844 174 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D TAH11P47112 604 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D NBP35P52920 328 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D YGR250CP53316 781 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D VAC7P53950 1165 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D NHX1Q04121 633 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D RRN11Q04712 507 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D DIC1Q06143 298 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D ATG23Q06671 453 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D SKM1Q12469 655 aa3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D NOP14Q99207 810 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D TOR1P35169 2470 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D GAL4P04386 881 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D CMD1P06787 147 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D GCR1P07261 785 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D SWI5P08153 709 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D RPB4P20433 221 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D CIN8P27895 1000 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D CWP1P28319 239 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D GCD6P32501 712 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D YME1P32795 747 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D TFC3P34111 1160 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D EMC3P36039 253 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data3.25□□□□□ -1.89not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D YHR033WP38690 423 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D DED81P38707 554 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D DMA1P38823 416 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D REV7P38927 245 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D YEL073CP39974 107 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D YER034WP40022 185 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D TES1P41903 349 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D MTO1P53070 669 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D MPS2P53159 387 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D RIM8P53179 542 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D GND2P53319 492 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D NAM8Q00539 523 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D YDR132CQ03900 495 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D URH1Q04179 340 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D YDR278CQ05612 105 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D ADE13Q05911 482 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D RSC2Q06488 889 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D CUE5Q08412 411 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D VHS3Q08438 674 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D NUR1Q12066 484 aa3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D ADH4P10127 382 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D NSP1P14907 823 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D CBF1P17106 351 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D STE4P18851 423 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D TRX2P22803 104 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D KAR4P25583 335 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D NTH1P32356 751 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D GCD11P32481 527 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D GDA1P32621 518 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D CDC13P32797 924 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D IRS4P36115 615 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D LAS1P36146 502 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D MRPL37P36532 105 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D SPP381P38282 291 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D RIM11P38615 370 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D MNN1P39106 762 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D CEM1P39525 442 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D ALR2P43553 858 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D CIS3P47001 227 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D NRM1P53718 249 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D RHO3Q00245 231 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D OSH6Q02201 448 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D SPP2Q02521 185 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D RCO1Q04779 684 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D CDC123Q05791 360 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D YLR177WQ06251 628 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D RSC3Q06639 885 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D SYT1Q06836 1226 aa3.24□□□□□ -1.89
tK(UUU)DtK(UUU)D BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 138.7 ms