RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC13A4Q9UKG4 626 aa20.39■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 POSTNQ15063 836 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 MEIS3Q99687 375 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.39■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF202O95125 648 aa20.39■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 DEXIO95424 95 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 ATF2P15336 505 aa20.37■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 STAT1P42224 750 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT80Q6KB66 452 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 C16orf87Q6PH81 154 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 CENPKQ9BS16 269 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 ANO1Q5XXA6 986 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 POLE2P56282 527 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 NLRP12P59046 1061 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 STX1BP61266 288 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 TBCCQ15814 346 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXL13Q8NEE6 735 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC4A1P02730 911 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 28.9
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PTPRJ-207ENST00000613246 TEX11Q8IYF3 940 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 SKOR1P84550 965 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa20.35■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 KRT33BQ14525 404 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 TPH2Q8IWU9 490 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 RAD50Q92878 1312 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 BUB1O43683 1085 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP2J2P51589 502 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF169Q8NCN4 708 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRJ-207ENST00000613246 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.35■□□□□ 0.85
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