RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 SV2BQ7L1I2 683 aa7.07□□□□□ -1.28
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SMAD4-212ENST00000591126 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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SMAD4-212ENST00000591126 PSMA7O14818 248 aa7.07□□□□□ -1.28
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SMAD4-212ENST00000591126 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.06□□□□□ -1.28
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SMAD4-212ENST00000591126 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
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SMAD4-212ENST00000591126 TBC1D22BQ9NU19 505 aa7.05□□□□□ -1.28
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SMAD4-212ENST00000591126 STAT3P40763 770 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-212ENST00000591126 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-212ENST00000591126 BCL9O00512 1426 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-212ENST00000591126 UTYO14607 1347 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-212ENST00000591126 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-212ENST00000591126 GAS8O95995 478 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD4-212ENST00000591126 TNNC2P02585 160 aa7.05□□□□□ -1.28
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