RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 GH2P01242 217 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFRSF25Q93038 417 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.791e-7■■■□□ 14.8
CAPNS1-207ENST00000589146 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 CLIC4Q9Y696 253 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.794e-7■■■□□ 18.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CALML3P27482 149 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF445P59923 1031 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GALNT17Q6IS24 598 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 OXER1Q8TDS5 423 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR7Q9Y216 660 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 BARHL2Q9NY43 387 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 HACL1Q9UJ83 578 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC39A14Q15043 492 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GINM1Q9NU53 330 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 STXBP3O00186 592 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP5P59047 1200 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP2B2Q01814 1243 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 NR5A1Q13285 461 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 STK38Q15208 465 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPAQ15257 358 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SLFN13Q68D06 897 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR8Q96EF0 704 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 GMCL1Q96IK5 515 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SPTLC2O15270 562 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CAP2P40123 477 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PQ27 194 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PQ64 194 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PQD8 194 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PHF20L1A8MW92 1017 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP6R2O75170 966 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ADALQ6DHV7 355 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PIBF1Q8WXW3 757 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CPVLQ9H3G5 476 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 GPCPD1Q9NPB8 672 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 FSD2A1L4K1 749 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PIGSQ96S52 555 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF181Q9P0P0 153 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 TMX2Q9Y320 296 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ESYT2A0FGR8 921 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 F5H6K3 240 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R2N6 131 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 KLRC3Q07444 240 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC96Q2M329 555 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 BLIDQ8IZY5 108 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 JMJD4Q9H9V9 463 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PRG0 241 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFB10O96000 172 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 LIG1P18858 919 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC1A4P43007 532 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ME1P48163 572 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAPPC10P48553 1259 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRF4Q8IZF3 695 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 JMYQ8N9B5 988 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 HOOK2Q96ED9 719 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.15■■□□□ 1.78
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