RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 MIPEPQ99797 713 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPN18Q99952 460 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR62Q9BZJ7 368 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUDT19A8MXV4 375 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 APBB1O00213 710 aa1.19□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ULK2Q8IYT8 1036 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSRNP2Q9H175 543 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 MMRN2Q9H8L6 949 aa1.19□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBRSQ9HAH7 460 aa1.19□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa1.19□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ITPKAP23677 461 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 EPHB4P54760 987 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAAP100Q0VG06 881 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP1.18□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCE1CQ5T751 118 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR150Q8NGU9 434 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMEPA1Q969W9 287 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 MEGF9Q9H1U4 602 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAM29Q9UKF5 820 aa1.18□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOTCH3Q9UM47 2321 aa1.18□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ADH4P08319 380 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAPKAPK2P49137 400 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM69CQ0P6D2 419 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA2012Q0VF49 1180 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 NKG7Q16617 165 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 WASHC4Q2M389 1173 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 C9orf131Q5VYM1 1079 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 LETMD1Q6P1Q0 360 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 STK35Q8TDR2 534 aa1.17□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PRRX2Q99811 253 aa1.17□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GJA4P35212 333 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAP2P40123 477 aa1.16□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM26FQ5R3K3 315 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 C16orf46Q6P387 395 aa1.16□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 MAP6Q96JE9 813 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CSADQ9Y600 493 aa1.16□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 SURF1Q15526 300 aa1.15□□□□□ -2.23
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GPBAR1Q8TDU6 330 aa1.15□□□□□ -2.23
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC24A3Q9HC58 644 aa1.15□□□□□ -2.23
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CD38P28907 300 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF76P36508 570 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CAPN12Q6ZSI9 719 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1QL2Q7Z5L3 287 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATCAYQ86WG3 371 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADGRG3Q86Y34 549 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 MFSD2AQ8NA29 543 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 DTWD2Q8NBA8 298 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKS1AQ92625 1134 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRDM13Q9H4Q3 707 aa1.14□□□□□ -2.23
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