RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPRUQ92729 1446 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GCNT3O95395 438 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCG2P13521 617 aa18.46■□□□□ 0.55
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.46■□□□□ 0.55
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.46■□□□□ 0.55
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.547e-7■■■■□ 24.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOX5Q96PH1 765 aa18.45■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR8K1Q8NGG5 319 aa18.45■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNJ12Q14500 433 aa18.44■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPH2Q8IWU9 490 aa18.44■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.44■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.43■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa18.43■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.43■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC39A2Q9NP94 309 aa18.43■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MORC3Q14149 939 aa18.43■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VWA3BQ502W6 1294 aa18.43■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LZTS2Q9BRK4 669 aa18.43■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSRNP2Q9H175 543 aa18.42■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHA12Q9UN75 941 aa18.42■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DIP2AQ14689 1571 aa18.42■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP18.42■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMTNP53814 917 aa18.42■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa18.42■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NF2P35240 595 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR16Q569H4 304 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NLRP10Q86W26 655 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC26Q8TAB7 109 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BTDP43251 543 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEL1L2Q5TEA6 688 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VTI1AQ96AJ9 217 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSWIM5Q9P217 1185 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC121Q6ZUS5 278 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP57Q86XR8 500 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TEKT1Q969V4 418 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR108Q9NPR9 543 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED23Q9ULK4 1368 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CIAO1O76071 339 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCORLQ8N3X6 602 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLT8D2Q9H1C3 349 aa18.41■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADD2P35612 726 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSTPIP2Q9H939 334 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR44Q5JSH3 913 aa18.4■□□□□ 0.54
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