RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 BTBD7Q9P203 1132 aa24.59■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 PORCNQ9H237 461 aa24.58■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
NELFE-208ENST00000481121 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 SOX10P56693 466 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 MB21D1Q8N884 522 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 ESR2Q92731 530 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 ATG4CQ96DT6 458 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.57■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 GRK4P32298 578 aa24.56■■□□□ 1.52
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NELFE-208ENST00000481121 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.56■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 ZNF333Q96JL9 665 aa24.56■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 IRF5Q13568 498 aa24.56■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.56■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.56■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 NT5C2P49902 561 aa24.55■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 PTH1RQ03431 593 aa24.55■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 WDR78Q5VTH9 848 aa24.55■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 SLFN13Q68D06 897 aa24.55■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 GPR142Q7Z601 462 aa24.55■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.55■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 ADCY3O60266 1144 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 SPATC1LQ9H0A9 340 aa24.54■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.54■■□□□ 1.52
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NELFE-208ENST00000481121 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 NOVP48745 357 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 PLS1Q14651 629 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.53■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 BMP3P12645 472 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 GMCL1Q96IK5 515 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 GJD2Q9UKL4 321 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.52■■□□□ 1.52
NELFE-208ENST00000481121 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 B4E1Z4 1266 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 VWA5AO00534 786 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 KDM4AO75164 1064 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 ELNP15502 786 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 KRT23Q9C075 422 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 FEM1BQ9UK73 627 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.51■■□□□ 1.51
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NELFE-208ENST00000481121 IQCA1Q86XH1 822 aa24.51■■□□□ 1.51
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NELFE-208ENST00000481121 CYP21A2P08686 494 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 UBXN2AP68543 259 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 TMEM132BQ14DG7 1078 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 CASC1Q6TDU7 716 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 KIFC2Q96AC6 838 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 CDC45O75419 566 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 CYP2B6P20813 491 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 MCCP23508 829 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 STAT2P52630 851 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 MAP4K1Q92918 833 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 TTC14Q96N46 770 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 TMEM232C9JQI7 657 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 ERCC3P19447 782 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 RGS2P41220 211 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 MORN1Q5T089 497 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 MROH8Q9H579 483 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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NELFE-208ENST00000481121 PTPREP23469 700 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 TRDNQ13061 729 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 CCDC96Q2M329 555 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 KCTD1Q719H9 257 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 REPS2Q8NFH8 660 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 DCAF4Q8WV16 495 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 APBA2Q99767 749 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
NELFE-208ENST00000481121 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.46■■□□□ 1.51
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