RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 FAM83BQ5T0W9 1011 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 CTR9Q6PD62 1173 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 MAML3Q96JK9 1138 aa13.51□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.51□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 KBTBD13C9JR72 458 aa13.5□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 STRNO43815 780 aa13.5□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 MROH8Q9H579 483 aa13.49□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa13.49□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 DDX19BQ9UMR2 479 aa13.49□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.258e-19■□□□□ 10.2
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ACTB-209ENST00000473257 STAT3P40763 770 aa13.47□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 GSG1L2A8MUP6 293 aa13.46□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 PRDM1O75626 825 aa13.46□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 OSBP2Q969R2 916 aa13.46□□□□□ -0.25
ACTB-209ENST00000473257 TINF2Q9BSI4 451 aa13.46□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 KANSL2Q9H9L4 492 aa13.46□□□□□ -0.25
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ACTB-209ENST00000473257 M0R2C6 588 aa13.45□□□□□ -0.26
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ACTB-209ENST00000473257 NDUFB10O96000 172 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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ACTB-209ENST00000473257 SNX17Q15036 470 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 AMOTL1Q8IY63 956 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 CPXCR1Q8N123 301 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 GOPCQ9HD26 462 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 SLC5A4Q9NY91 659 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 RCAN3Q9UKA8 241 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 PHF24Q9UPV7 400 aa13.45□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PQY0 241 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 ADCY6O43306 1168 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 MS4A1P11836 297 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 PTGS1P23219 599 aa13.44□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ACTB-209ENST00000473257 MYLIPQ8WY64 445 aa13.44□□□□□ -0.26
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