RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 SMPD1P17405 629 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PRR20EP86478 221 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PRR20CP86479 221 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PRR20DP86480 221 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PRR20BP86481 221 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PRR20AP86496 221 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PRKCZQ05513 592 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 C11orf49Q9H6J7 331 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ELP3Q9H9T3 547 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 FRMPD3Q5JV73 1810 aa5.32□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.31□□□□□ -1.56
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ECHDC1-211ENST00000460558 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 J3QL48 77 aa5.31□□□□□ -1.56
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ECHDC1-211ENST00000460558 UFL1O94874 794 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 CETPP11597 493 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 CTGFP29279 349 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 FCGRTP55899 365 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
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ECHDC1-211ENST00000460558 EHHADHQ08426 723 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 C17orf99Q6UX52 265 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM67Q6ZTA4 783 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PODNQ7Z5L7 613 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 AGBL1Q96MI9 1066 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 SPEF2Q9C093 1822 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ATRXP46100 2492 aa5.31□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM186AA6NE01 2351 aa5.3□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.3□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa5.3□□□□□ -1.56
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ECHDC1-211ENST00000460558 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
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ECHDC1-211ENST00000460558 FOXC1Q12948 553 aa5.3□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ATCAYQ86WG3 371 aa5.3□□□□□ -1.56
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ECHDC1-211ENST00000460558 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.3□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
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ECHDC1-211ENST00000460558 CPA4Q9UI42 421 aa5.3□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 GGA1Q9UJY5 639 aa5.3□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF804BA4D1E1 1349 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 BTBD19C9JJ37 291 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 MEN1O00255 615 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 MYO1BO43795 1136 aa5.29□□□□□ -1.56
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZAP70P43403 619 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 RELBQ01201 579 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 NHLH1Q02575 133 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 SNAPC2Q13487 334 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 IER5Q5VY09 327 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PPM1EQ8WY54 764 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 CSADQ9Y600 493 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 CACNA1HO95180 2353 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPRFP10586 1907 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 MYH3P11055 1940 aa5.29□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PFASO15067 1338 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 SMIM22K7EJ46 135 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 MYL6BP14649 208 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 TXLNAP40222 546 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 FLT3LGP49771 235 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 PLCB3Q01970 1234 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 VGLL4Q14135 290 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 GRIN2CQ14957 1233 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 DLGAP5Q15398 846 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 SHHQ15465 462 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 AAK1Q2M2I8 961 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 C4orf17Q53FE4 359 aa5.28□□□□□ -1.56
ECHDC1-211ENST00000460558 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa5.28□□□□□ -1.56
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