RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA0825Q8IV33 1275 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 XAGE3Q8WTP9 111 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 XYLT2Q9H1B5 865 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 CAPN10Q9HC96 672 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 BRMS1Q9HCU9 246 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 TJP2Q9UDY2 1190 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.89□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 SUV39H1O43463 412 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 APOBRQ0VD83 1088 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 COX4I2Q96KJ9 171 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 DRC1Q96MC2 740 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 GMLQ99445 158 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 NT5C1AQ9BXI3 368 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 UPK3BL1B0FP48 263 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 UPK3BL2E5RIL1 263 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 LRIG2O94898 1065 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 GJA8P48165 433 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 TNNI2P48788 182 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 HK2P52789 917 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM87BQ96K49 555 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 LRRC3Q9BY71 257 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 REV1Q9UBZ9 1251 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa4.88□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 HTR3BO95264 441 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 MCM4P33991 863 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 PAK2Q13177 524 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 SP8Q8IXZ3 490 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 RIN3Q8TB24 985 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 NKD1Q969G9 470 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 UBE2FQ969M7 185 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 USP35Q9P2H5 1018 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ADAM30Q9UKF2 790 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 MYRFQ9Y2G1 1151 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ST14Q9Y5Y6 855 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 PRR36Q9H6K5 1346 aa4.87□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 SLITRK5O94991 958 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 CAP2P40123 477 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 SLC6A19Q695T7 634 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF605Q86T29 641 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 OXR1Q8N573 874 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 RASGRP4Q8TDF6 673 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 TEPSINQ96N21 525 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 MIPEPQ99797 713 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 RNF32Q9H0A6 362 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 KLHL3Q9UH77 587 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJA2O60884 412 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 CLCQ05315 142 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM201Q5SNT2 666 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 GK5Q6ZS86 529 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 FAM13CQ8NE31 585 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 GPRASP2Q96D09 838 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 SPATA32Q96LK8 384 aa4.86□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 CYP7A1P22680 504 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 KIR3DL1P43629 444 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 EFEMP1Q12805 493 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 LETMD1Q6P1Q0 360 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 VPS37DQ86XT2 251 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 PDZD8Q8NEN9 1154 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ZSWIM5Q9P217 1185 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ATE1O95260 518 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ERVFC1P60507 584 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 ARID5AQ03989 594 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 RALGPS1Q5JS13 557 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 CDH24Q86UP0 819 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 UBXN4Q92575 508 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 GPR20Q99678 358 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 PALD1Q9ULE6 856 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC82-202ENST00000423339 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 FITM1A5D6W6 292 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 SLC22A31A6NKX4 558 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 PRR33A8MZF0 331 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF165P49910 485 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 YARSP54577 528 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 ARMC5Q96C12 935 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC82-202ENST00000423339 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms