RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 CHL1O00533 1208 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 FAM200BP0CF97 657 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 PARP10Q53GL7 1025 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 CEP70Q8NHQ1 597 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 TRIM17Q9Y577 477 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 ADGRB3O60242 1522 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 KRT75O95678 551 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 MAP3K9P80192 1104 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 KIF5AQ12840 1032 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 CEP152O94986 1710 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 E7EVH7 732 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 TNIP1Q15025 636 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 STK38LQ9Y2H1 464 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 C1orf167Q5SNV9 1468 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 MLH1P40692 756 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 HOOK2Q96ED9 719 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 LDHCP07864 332 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 ZNF131P52739 623 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 SLF2Q8IX21 1173 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.17■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 LDHAP00338 332 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 MYL1P05976 194 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 SCNN1BP51168 640 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 NAPBQ9H115 298 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 CLCN2P51788 898 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 RNF40O75150 1001 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 C6orf163Q5TEZ5 329 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.16■□□□□ 0.022e-8■□□□□ 10.1
CTIF-202ENST00000382998 ALKQ9UM73 1620 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 RHPN1Q8TCX5 695 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 HIC2Q96JB3 615 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 SMC6Q96SB8 1091 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 SIKE1Q9BRV8 207 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 CHMP2BQ9UQN3 213 aa15.16■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 FERMT3Q86UX7 667 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 CCDC83Q8IWF9 413 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 PDHA1P08559 390 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 MAIP1Q8WWC4 291 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 IFT81Q8WYA0 676 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 PIGBQ92521 554 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 OPTNQ96CV9 577 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 ANO10Q9NW15 660 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 AHCYL1O43865 530 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 UFL1O94874 794 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 FOSL1P15407 271 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 VMP1Q96GC9 406 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 TTC1Q99614 292 aa15.15■□□□□ 0.02
CTIF-202ENST00000382998 TSPY2A6NKD2 308 aa15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 TSPY3P0CV98 308 aa15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 TSPY8P0CW00 308 aa15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 ATP8B2P98198 1209 aa15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 TSPY1Q01534 308 aa15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 APOBRQ0VD83 1088 aa15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 TRIM50Q86XT4 487 aa15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 EYA3Q99504 573 aa15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 ARPC5LQ9BPX5 153 aa15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 PARD6BQ9BYG5 372 aa15.14■□□□□ 0.01
CTIF-202ENST00000382998 WDR70Q9NW82 654 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms