RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243077.7

LRP1-201, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 14,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-201ENST00000243077 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 JDP2Q8WYK2 163 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 PANX2Q96RD6 677 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 AZI2Q9H6S1 392 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 COG7P83436 770 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 TFCP2Q12800 502 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 MORC3Q14149 939 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 TESK2Q96S53 571 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 ATG3Q9NT62 314 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 SLC1A4P43007 532 aa9.9□□□□□ -0.82
LRP1-201ENST00000243077 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 GPAA1O43292 621 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ALCAMQ13740 583 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 RRAGAQ7L523 313 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ERCC3P19447 782 aa9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 VPS16Q9H269 839 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 TTC4O95801 387 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.835e-7■■□□□ 13.1
LRP1-201ENST00000243077 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 VEZTQ9HBM0 779 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 SMIM23A6NLE4 172 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 GAP43P17677 238 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 MTX1Q13505 466 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 PRPSAP1Q14558 356 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ZBED4O75132 1171 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 RIMS2Q9UQ26 1411 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 EXOC3O60645 756 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 SKIP12755 728 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ZNF233A6NK53 670 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 LRCH2Q5VUJ6 765 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 NLRX1Q86UT6 975 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 IGSF3O75054 1194 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 RSPH3Q86UC2 560 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 KIFC3Q9BVG8 833 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 EMBQ6PCB8 327 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 NPATQ14207 1427 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 PFKFB2O60825 505 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 C2CD5Q86YS7 1000 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 MYCT1Q8N699 235 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 TRIM15Q9C019 465 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 STAP2Q9UGK3 403 aa9.89□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 SURF1Q15526 300 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 SERPINI1Q99574 410 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 MXD3Q9BW11 206 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 KCNJ18B7U540 433 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 KCNJ12Q14500 433 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 PLCB4Q15147 1175 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 PPP2R5AQ15172 486 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 FANCAO15360 1455 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 FAM83GA6ND36 823 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 CAV1Q03135 178 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ARHGEF10O15013 1369 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 RASA3Q14644 834 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 TRIM4Q9C037 500 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.88□□□□□ -0.83
LRP1-201ENST00000243077 ZNF790Q6PG37 636 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms