RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PAGR1Q9BTK6 254 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 KRT23Q9C075 422 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 MYPNQ86TC9 1320 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JMZ2 1700 aa26.29■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 CENPFP49454 3210 aa26.28■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 E7EWF7 191 aa26.28■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 GNRH1P01148 92 aa26.28■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.28■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 ANKS1AQ92625 1134 aa26.28■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 ABHD8Q96I13 439 aa26.28■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 SLC27A2O14975 620 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 FCGRTP55899 365 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF6Q15052 776 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 CASC1Q6TDU7 716 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 GMCL1Q96IK5 515 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 PORCNQ9H237 461 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 SRRDQ9UH36 339 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.27■■□□□ 1.8
SYF2-201ENST00000236273 MCCP23508 829 aa26.26■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.26■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 DGKHQ86XP1 1220 aa26.26■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 REPS2Q8NFH8 660 aa26.26■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 GABRQQ9UN88 632 aa26.26■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.26■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 BMP3P12645 472 aa26.25■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.25■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 GJD2Q9UKL4 321 aa26.25■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa26.25■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 PRKCZQ05513 592 aa26.24■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 PLXNB2O15031 1838 aa26.24■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 VWA5AO00534 786 aa26.23■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 TMEM132BQ14DG7 1078 aa26.23■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 SEC23AQ15436 765 aa26.23■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 IQCA1Q86XH1 822 aa26.23■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 SLF1Q9BQI6 1058 aa26.23■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 TNKSO95271 1327 aa26.22■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 SLC1A4P43007 532 aa26.22■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 PRMT2P55345 433 aa26.22■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 ANTXR2P58335 489 aa26.22■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 MB21D1Q8N884 522 aa26.22■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 NCOA7Q8NI08 942 aa26.22■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 SPATC1LQ9H0A9 340 aa26.22■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 FEM1BQ9UK73 627 aa26.22■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G6O60733 806 aa26.21■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 SNHG28P0DPA3 235 aa26.21■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 HOXD10P28358 340 aa26.21■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 TRDNQ13061 729 aa26.21■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.21■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 KCTD1Q719H9 257 aa26.21■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 RASEFQ8IZ41 740 aa26.21■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 TMEM232C9JQI7 657 aa26.2■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 PDHBP11177 359 aa26.2■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 MAPK4P31152 587 aa26.2■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 FLT3LGP49771 235 aa26.2■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 DCAF4Q8WV16 495 aa26.2■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 MTMR7Q9Y216 660 aa26.2■■□□□ 1.79
SYF2-201ENST00000236273 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.19■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 CHST3Q7LGC8 479 aa26.19■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 GPR142Q7Z601 462 aa26.19■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 USP6NLQ92738 828 aa26.19■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 KCNB2Q92953 911 aa26.19■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 COA7Q96BR5 231 aa26.19■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 SENP2Q9HC62 589 aa26.19■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.18■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.18■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.18■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 CCNA1P78396 465 aa26.17■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 MORN1Q5T089 497 aa26.17■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.17■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHH3Q7Z736 793 aa26.17■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 PNMA1Q8ND90 353 aa26.17■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 KIFC2Q96AC6 838 aa26.17■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.17■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 ERCC3P19447 782 aa26.16■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 STAT2P52630 851 aa26.16■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 ZNF543Q08ER8 600 aa26.16■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 IRF5Q13568 498 aa26.16■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 FAM160B2Q86V87 743 aa26.16■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 SHCBP1Q8NEM2 672 aa26.16■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.16■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 ARMC5Q96C12 935 aa26.16■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 ATP2A1O14983 1001 aa26.15■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 STAT3P40763 770 aa26.15■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 RIOX2Q8IUF8 465 aa26.15■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 KAT14Q9H8E8 782 aa26.15■■□□□ 1.78
SYF2-201ENST00000236273 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms