RNA–Protein interactions for RNA: YNL296W

YNL296W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL296W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL296W	YNL296W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	STE6	P12866	1290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	URA4	P20051	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	EPT1	P22140	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	GDA1	P32621	518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	KAE1	P36132	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	IML3	P38265	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YIL054W	P40524	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	GAD1	Q04792	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YDR338C	Q05497	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	SWC7	Q06707	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	SPO75	Q07798	868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
YNL296W	YNL296W	PGC1	Q08959	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	SEY1	Q99287	776 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	KAR3	P17119	729 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	GAL11	P19659	1081 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	IMG1	P25626	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	MSH1	P25846	959 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	PET112	P33893	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	SCD5	P34758	872 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	TFA2	P36145	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	TAT1	P38085	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YBR259W	P38338	688 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YHL008C	P38750	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	TDA3	P38758	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
YNL296W	YNL296W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	PRY1	P47032	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YGR237C	P50089	785 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ARP4	P80428	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ISU1	Q03020	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	CIA1	Q05583	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	HUA2	Q12134	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	GPM3	Q12326	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	MDM35	O60200	86 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	BI2	P03873	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	BIK1	P11709	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	RBK1	P25332	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	SKN1	P33336	771 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	GMH1	P36125	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	MRPL37	P36532	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	SWC5	P38326	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YHR033W	P38690	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	CYC2	P38909	366 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	BET4	Q00618	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	REG1	Q00816	1014 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	CCE1	Q03702	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	LDB18	Q07887	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YAP7	Q08182	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ADH7	P25377	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ATG15	P25641	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	CPR3	P25719	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	RRN6	P32786	894 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	NIP100	P33420	868 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	OMA1	P36163	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	MRPL15	P36523	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	GPI16	P38875	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	LRO1	P40345	661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ELP2	P42935	788 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YET2	Q04210	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	DIN7	Q12086	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	WTM2	Q12206	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	COX5A	P00424	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	AI3	P03877	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL296W	YNL296W	HOM3	P10869	527 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.7 ms