RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608263.5

CTCFL-216, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 4,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-216ENST00000608263 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 GPR108Q9NPR9 543 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 IKBKBO14920 756 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 TEX33O43247 280 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 PAK1Q13153 545 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 GRIN1Q05586 938 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 WDR24Q96S15 920 aa11.66□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 POTEB2H3BUK9 544 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 ZBTB7AO95365 584 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 NOP2P46087 812 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 KIF5AQ12840 1032 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 HDXQ7Z353 690 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 RGS22Q8NE09 1264 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 FAM205CA6NFA0 338 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 ANTXR2P58335 489 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 RASGRF1Q13972 1273 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 CALML4Q96GE6 196 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 RMND1Q9NWS8 449 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 PPIP5K2O43314 1243 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 KRT86O43790 486 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 PPP6R2O75170 966 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 ZSCAN26Q16670 478 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 TEX11Q8IYF3 940 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 KCNB2Q92953 911 aa11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTCFL-216ENST00000608263 TMCO5BA8MYB1 307 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 STX10O60499 249 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 CIAO1O76071 339 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 KIAA0754O94854 1291 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 BMP15O95972 392 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 GOLGA8HP0CJ92 632 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 SCNN1DP51172 638 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 PDE4DQ08499 809 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 UBE3CQ15386 1083 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 PTPROQ16827 1216 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 IQCEQ6IPM2 695 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 DYMQ7RTS9 669 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 RTL9Q8NET4 1388 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 NLRP10Q86W26 655 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 IFT81Q8WYA0 676 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 TAF4BQ92750 862 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 ZEB2O60315 1214 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 MMP1P03956 469 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 LONRF2Q1L5Z9 754 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 EYA3Q99504 573 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 GOLGA6L10A6NI86 522 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 ATP2C2O75185 946 aa11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 TXKP42681 527 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 PLCD1P51178 756 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 PALLDQ8WX93 1383 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 MMP10P09238 476 aa11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.551e-7■■□□□ 12.2
CTCFL-216ENST00000608263 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTCFL-216ENST00000608263 SPATA1Q5VX52 437 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms