RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592647.1

TRAPPC6A-205, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ACER1Q8TDN7 264 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 IRF6O14896 467 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PRC1O43663 620 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PSMA5P28066 241 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MCM5P33992 734 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 GTF2A2P52657 109 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PPIL2Q13356 520 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 STX8Q9UNK0 236 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.23■■□□□ 1.63
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 ANTXR2P58335 489 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CCL15Q16663 113 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 FEZ1Q99689 392 aa25.23■■□□□ 1.63
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 TMEM106CQ9BVX2 250 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.23■■□□□ 1.63
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 CAP1Q01518 475 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 NYAP2Q9P242 653 aa25.22■■□□□ 1.63
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 USP17L10C9JJH3 530 aa25.21■■□□□ 1.63
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 MTMR2Q13614 643 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZNF333Q96JL9 665 aa25.21■■□□□ 1.63
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 RAD21O60216 631 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 RBM25P49756 843 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa25.2■■□□□ 1.62
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.19■■□□□ 1.62
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.19■■□□□ 1.62
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 HMGCS2P54868 508 aa25.18■■□□□ 1.62
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.18■■□□□ 1.62
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 SH2D4AQ9H788 454 aa25.18■■□□□ 1.62
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 SEC23AQ15436 765 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.17■■□□□ 1.62
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TRAPPC6A-205ENST00000592647 MKL1Q969V6 931 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TMX2Q9Y320 296 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 C19orf81C9J6K1 198 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 CETPP11597 493 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 TMEM87BQ96K49 555 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 KAT14Q9H8E8 782 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-205ENST00000592647 SENP2Q9HC62 589 aa25.16■■□□□ 1.62
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