RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT40Q6A162 431 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA32Q96LK8 384 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 GINM1Q9NU53 330 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 NYAP2Q9P242 653 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 FIBPO43427 364 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 CALML3P27482 149 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFPM1Q8IX07 1006 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-212ENST00000591041 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 GUCY1B3Q02153 619 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 USP48Q86UV5 1035 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 SH2D4AQ9H788 454 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 MMP1P03956 469 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 SCG2P13521 617 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 GALNT17Q6IS24 598 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF4Q8WV16 495 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 MKL1Q969V6 931 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 KLRF2D3W0D1 207 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP2B2Q01814 1243 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 ICA1Q05084 483 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 PPFIA3O75145 1194 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 FUT2Q10981 343 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF15Q66K64 600 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 JMYQ8N9B5 988 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 DTNBO60941 627 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT2P35908 639 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF181Q9P0P0 153 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-212ENST00000591041 CNTNAP1P78357 1384 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH6P13533 1939 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 YEATS4O95619 227 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 PDHBP11177 359 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP5P59047 1200 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAF1Q13077 416 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 RASA3Q14644 834 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC18Q9H819 358 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 MTMR7Q9Y216 660 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 SNHG28P0DPA3 235 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 STK38Q15208 465 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC96Q2M329 555 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GOPCQ9HD26 462 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 BMP15O95972 392 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 ASNSP08243 561 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-212ENST00000591041 GSE1Q14687 1217 aa26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms