RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 BTBD7Q9P203 1132 aa29.52■■■□□ 2.32
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LAPTM4B-202ENST00000517924 UBXN2AP68543 259 aa29.51■■■□□ 2.31
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LAPTM4B-202ENST00000517924 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.51■■■□□ 2.31
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LAPTM4B-202ENST00000517924 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.51■■■□□ 2.31
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LAPTM4B-202ENST00000517924 ATP2B2Q01814 1243 aa29.49■■■□□ 2.31
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LAPTM4B-202ENST00000517924 EVI5LQ96CN4 794 aa29.49■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 VCPKMTQ9H867 229 aa29.49■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
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LAPTM4B-202ENST00000517924 MAPK4P31152 587 aa29.48■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
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LAPTM4B-202ENST00000517924 GPR142Q7Z601 462 aa29.48■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRDM1O75626 825 aa29.47■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 GJB1P08034 283 aa29.47■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRIB2Q92519 343 aa29.47■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 KANSL2Q9H9L4 492 aa29.47■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.47■■■□□ 2.31
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.46■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 NUCB1Q02818 461 aa29.45■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 COG2Q14746 738 aa29.45■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 MORN1Q5T089 497 aa29.45■■■□□ 2.31
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
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LAPTM4B-202ENST00000517924 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.45■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 SH2D4AQ9H788 454 aa29.45■■■□□ 2.31
LAPTM4B-202ENST00000517924 HMGCRP04035 888 aa29.44■■■□□ 2.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 VPS53Q5VIR6 699 aa29.44■■■□□ 2.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
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LAPTM4B-202ENST00000517924 SOCS4Q8WXH5 440 aa29.43■■■□□ 2.3
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LAPTM4B-202ENST00000517924 FLOT1O75955 427 aa29.42■■■□□ 2.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCNA1P78396 465 aa29.42■■■□□ 2.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCL14Q16627 93 aa29.42■■■□□ 2.3
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LAPTM4B-202ENST00000517924 DEFB118Q96PH6 123 aa29.42■■■□□ 2.3
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LAPTM4B-202ENST00000517924 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.41■■■□□ 2.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.41■■■□□ 2.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.41■■■□□ 2.3
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LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.39■■■□□ 2.3
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LAPTM4B-202ENST00000517924 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
LAPTM4B-202ENST00000517924 GOPCQ9HD26 462 aa29.39■■■□□ 2.3
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LAPTM4B-202ENST00000517924 CEP95Q96GE4 821 aa29.38■■■□□ 2.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPATC1LQ9H0A9 340 aa29.38■■■□□ 2.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 HELLSQ9NRZ9 838 aa29.38■■■□□ 2.29
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LAPTM4B-202ENST00000517924 APBA2Q99767 749 aa29.37■■■□□ 2.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.37■■■□□ 2.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLS1Q14651 629 aa29.36■■■□□ 2.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa29.36■■■□□ 2.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 OSBPL3Q9H4L5 887 aa29.36■■■□□ 2.29
LAPTM4B-202ENST00000517924 FLRT1Q9NZU1 646 aa29.36■■■□□ 2.29
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