RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIN3Q8TB24 985 aa1.26□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTGFRNQ9P2B2 879 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa1.26□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CDK4P11802 303 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRIA4P48058 902 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPRED3Q2MJR0 410 aa1.25□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR152Q8TDT2 470 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa1.25□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 USP17L4A6NCW7 530 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 EREGO14944 169 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 NRDCO43847 1150 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBX7O95931 251 aa1.24□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SEC13P55735 322 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEKQ02763 1124 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 USP17L2Q6R6M4 530 aa1.24□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 USP17L1Q7RTZ2 530 aa1.24□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ADGRE3Q9BY15 652 aa1.24□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa1.21□□□□□ -2.22
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF366Q8N895 744 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 HINFPQ9BQA5 517 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 A6NHS1 94 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXN1O15353 648 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1SP09871 688 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 EDN3P14138 238 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 MC3RP41968 323 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCRN1Q12765 414 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB3GAP1Q15042 981 aa1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RNU6-871P-201ENST00000516122 EXTL1Q92935 676 aa1.2□□□□□ -2.22
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