RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 VCPKMTQ9H867 229 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 PTPRFP10586 1907 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 HMGCS2P54868 508 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 ATP2B2Q01814 1243 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 LPAR1Q92633 364 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.88■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 AOC2O75106 756 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 RPS6KB1P23443 525 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 TM4SF4P48230 202 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 SREBF2Q12772 1141 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 GRM1Q13255 1194 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 CCL15Q16663 113 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 CHST3Q7LGC8 479 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 FBXL16Q8N461 479 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 ZIC5Q96T25 663 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 GOPCQ9HD26 462 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.87■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 ERICH2A1L162 156 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 RUFY3Q7L099 469 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 LIFRP42702 1097 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 WTAPQ15007 396 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 LY9Q9HBG7 655 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.85■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 MYH4Q9Y623 1939 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 F5H6K3 240 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 CPA1P15085 419 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 KLRC3Q07444 240 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 TMTC2Q8N394 836 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 KIF2CQ99661 725 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 PTPN18Q99952 460 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.84■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 NDUFB10O96000 172 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 VCAM1P19320 739 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 DGKZQ13574 1117 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 KAT14Q9H8E8 782 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTN3-202ENST00000511191 BTBD19C9JJ37 291 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 IFNL1Q8IU54 200 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 PNMA1Q8ND90 353 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 GMCL1Q96IK5 515 aa24.82■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 SNHG28P0DPA3 235 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 TREML2Q5T2D2 321 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 SLFN13Q68D06 897 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 SENP2Q9HC62 589 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 IL27Q8NEV9 243 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 DCAF4Q8WV16 495 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 Q6ZUG5 572 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L15C9J2P7 530 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L11C9JVI0 530 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L18D6R9N7 530 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L22D6RA61 530 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L19D6RCP7 530 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L20D6RJB6 530 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 ALDH1A1P00352 501 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 PDHBP11177 359 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L24Q0WX57 530 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 PDHXO00330 501 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 DDAH1O94760 285 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 BMP3P12645 472 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTN3-202ENST00000511191 SLC1A4P43007 532 aa24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms