RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 BCRP11274 1271 aa22.53■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 PSMC4P43686 418 aa22.53■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 HERVK_113P62684 666 aa22.53■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 CEP95Q96GE4 821 aa22.53■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 ABHD8Q96I13 439 aa22.53■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 IL25Q9H293 177 aa22.53■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.53■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.52■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.52■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.52■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.52■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 LPAR1Q92633 364 aa22.52■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.52■■□□□ 1.2
PITX1-204ENST00000504936 FCGRTP55899 365 aa22.51■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.51■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.51■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 NYAP2Q9P242 653 aa22.51■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 STX8Q9UNK0 236 aa22.51■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 ORC4O43929 436 aa22.5■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 TTLL1O95922 423 aa22.5■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.5■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 CASC1Q6TDU7 716 aa22.5■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.5■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.5■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.5■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 RLFQ13129 1914 aa22.5■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.49■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 SGSM2O43147 1006 aa22.49■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 FLOT1O75955 427 aa22.49■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.49■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.49■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.49■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.49■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 HOXD10P28358 340 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 CAP1Q01518 475 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 TRIM47Q96LD4 638 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 MTMR7Q9Y216 660 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 NEDD4P46934 1319 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.48■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 NMT2O60551 498 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 PEX10O60683 326 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 ESR2Q92731 530 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 NBPF3Q9H094 633 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 MYPNQ86TC9 1320 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 PLXNB2O15031 1838 aa22.47■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 GNRH1P01148 92 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 CTGFP29279 349 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 ERVK-9P63128 1117 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 ERVK-24P63145 666 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 PTH1RQ03431 593 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 WDR78Q5VTH9 848 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 RAET1EQ8TD07 263 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 COA7Q96BR5 231 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 CENPFP49454 3210 aa22.46■■□□□ 1.19
PITX1-204ENST00000504936 HTTP42858 3142 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 F5H6K3 240 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 CDC45O75419 566 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 NDUFB10O96000 172 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 KLRC3Q07444 240 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 COG2Q14746 738 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.45■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 PLS1Q14651 629 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 SRRDQ9UH36 339 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.44■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 B4E1Z4 1266 aa22.43■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 FGRP09769 529 aa22.43■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 PRMT2P55345 433 aa22.43■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 CCNA1P78396 465 aa22.43■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 PRKCZQ05513 592 aa22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms