RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 NBPF3Q9H094 633 aa15.25■□□□□ 0.03
PRAME-212ENST00000485532 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PRAME-212ENST00000485532 PFASO15067 1338 aa15.24■□□□□ 0.03
PRAME-212ENST00000485532 CAPN2P17655 700 aa15.24■□□□□ 0.03
PRAME-212ENST00000485532 PTPREP23469 700 aa15.24■□□□□ 0.03
PRAME-212ENST00000485532 LHX8Q68G74 356 aa15.24■□□□□ 0.03
PRAME-212ENST00000485532 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.24■□□□□ 0.03
PRAME-212ENST00000485532 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.24■□□□□ 0.03
PRAME-212ENST00000485532 C11orf49Q9H6J7 331 aa15.24■□□□□ 0.03
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PRAME-212ENST00000485532 LBX2Q6XYB7 198 aa15.23■□□□□ 0.03
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PRAME-212ENST00000485532 USP17L21D6R901 530 aa15.22■□□□□ 0.03
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PRAME-212ENST00000485532 C12orf60Q5U649 245 aa15.22■□□□□ 0.03
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PRAME-212ENST00000485532 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
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PRAME-212ENST00000485532 DPP9Q86TI2 863 aa15.17■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.17■□□□□ 0.02
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PRAME-212ENST00000485532 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
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PRAME-212ENST00000485532 RAD21O60216 631 aa15.16■□□□□ 0.02
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PRAME-212ENST00000485532 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 OSBP2Q969R2 916 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 DCTPP1Q9H773 170 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.16■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 COL6A3P12111 3177 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PPC1 479 aa15.15■□□□□ 0.02
PRAME-212ENST00000485532 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
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