RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479589.5

NENF-204, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

TSL 2

Gene NENF, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-204ENST00000479589 TMX2Q9Y320 296 aa28.33■■■□□ 2.13
NENF-204ENST00000479589 CNMDO75829 334 aa28.32■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.32■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.32■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.32■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 LPAR1Q92633 364 aa28.32■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 PORCNQ9H237 461 aa28.32■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 RASA1P20936 1047 aa28.31■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 LBX2Q6XYB7 198 aa28.31■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.31■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 NAPBQ9H115 298 aa28.31■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 VCPKMTQ9H867 229 aa28.31■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 CCNA1P78396 465 aa28.3■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 NUCB1Q02818 461 aa28.3■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 UNC93B1Q9H1C4 597 aa28.3■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 ZNF287Q9HBT7 754 aa28.3■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.3■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 PLXNB2O15031 1838 aa28.29■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.29■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 COG2Q14746 738 aa28.29■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 GPR142Q7Z601 462 aa28.29■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 SOCS4Q8WXH5 440 aa28.29■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 NUDT12Q9BQG2 462 aa28.29■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 BTBD7Q9P203 1132 aa28.29■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 PRDM1O75626 825 aa28.28■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 GJB1P08034 283 aa28.28■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 PLEKHH3Q7Z736 793 aa28.28■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 NKX2-3Q8TAU0 364 aa28.28■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 HOXC10Q9NYD6 342 aa28.28■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 RAD21O60216 631 aa28.27■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 CYP2B6P20813 491 aa28.27■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 WDR78Q5VTH9 848 aa28.27■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 GOPCQ9HD26 462 aa28.27■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
NENF-204ENST00000479589 WDR46O15213 610 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 FLOT1O75955 427 aa28.26■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 HMGCRP04035 888 aa28.26■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 GJA8P48165 433 aa28.26■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.26■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 RILPL2Q969X0 211 aa28.26■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 SHISA4Q96DD7 197 aa28.26■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.26■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 PPARAQ07869 468 aa28.25■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 FAM227BQ96M60 508 aa28.25■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 PDE4BQ07343 736 aa28.24■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 A0A0D9SFI3 127 aa28.23■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 FOXP2O15409 715 aa28.23■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 DSG3P32926 999 aa28.23■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 RGS2P41220 211 aa28.23■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 MORN1Q5T089 497 aa28.23■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 VPS53Q5VIR6 699 aa28.23■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 TRIB2Q92519 343 aa28.23■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 NYAP2Q9P242 653 aa28.23■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 RLFQ13129 1914 aa28.23■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.23■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 TRIM32Q13049 653 aa28.22■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.22■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 TICAM2Q86XR7 235 aa28.22■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 MB21D1Q8N884 522 aa28.22■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 USP6NLQ92738 828 aa28.22■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 ATG4CQ96DT6 458 aa28.22■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 OSBPL3Q9H4L5 887 aa28.22■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 DEFB118Q96PH6 123 aa28.21■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 APBA2Q99767 749 aa28.21■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.21■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 CLIP2Q9UDT6 1046 aa28.21■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa28.21■■■□□ 2.11
NENF-204ENST00000479589 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 SGPL1O95470 568 aa28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 TSPY3P0CV98 308 aa28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 TSPY8P0CW00 308 aa28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 PLS1Q14651 629 aa28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 FAM83BQ5T0W9 1011 aa28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 CEP95Q96GE4 821 aa28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 SLC15A5A6NIM6 579 aa28.19■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 PTPREP23469 700 aa28.19■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 CTDSPL2Q05D32 466 aa28.19■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 MAP2K5Q13163 448 aa28.19■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.19■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 FBXO28Q9NVF7 368 aa28.19■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 PARP14Q460N5 1801 aa28.18■■■□□ 2.1
NENF-204ENST00000479589 TFRCP02786 760 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.9 ms