RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 AFMP43652 599 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 RBL2Q08999 1139 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 RASGRF1Q13972 1273 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT23Q9C075 422 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 RPS6KA5O75582 802 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 DEXIO95424 95 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM182BQ5T319 152 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 EPSTI1Q96J88 318 aa20.78■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 TDO2P48775 406 aa20.77■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBB4BP68371 445 aa20.77■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 SUSD4Q5VX71 490 aa20.77■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.77■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.77■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB9Q96C00 473 aa20.77■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 NID2Q14112 1375 aa20.77■□□□□ 0.92
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH3P11055 1940 aa20.77■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP3K12Q12852 859 aa20.77■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.77■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 KANK3Q6NY19 840 aa20.77■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM5Q71RC9 77 aa20.77■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 LCORLQ8N3X6 602 aa20.77■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SHISA4Q96DD7 197 aa20.77■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMTA2O94983 1202 aa20.76■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.76■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.76■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 LPIN2Q92539 896 aa20.76■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CTAGE9A4FU28 777 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 VSNL1P62760 191 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 FANCBQ8NB91 859 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 FGFR2P21802 821 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC35F6Q8N357 371 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.75■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 ERICH2A1L162 156 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 PBX1P40424 430 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CASP8Q14790 479 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA1Q5VX52 437 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 PDE8AO60658 829 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 COBLO75128 1261 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CUL4BQ13620 913 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00116Q8NCU8 138 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 USP21Q9UK80 565 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.74■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 MFAP3LO75121 409 aa20.73■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CASP14P31944 242 aa20.73■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM71BQ8TC56 605 aa20.73■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.73■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 WNT7AO00755 349 aa20.73■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 PAGE5Q96GU1 130 aa20.73■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 GBP3Q9H0R5 595 aa20.73■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM22K7EJ46 135 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM75PA6NK02 468 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDM1O75626 825 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CTAGE8P0CG41 777 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 STAMQ92783 540 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC102AQ96A19 550 aa20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH6P13533 1939 aa20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 MYH8P13535 1937 aa20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 ABL1P00519 1130 aa20.71■□□□□ 0.91
RALGPS1-208ENST00000424082 GYPCP04921 128 aa20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.1 ms