RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPR142Q7Z601 462 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRIB2Q92519 343 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 RNF208Q9H0X6 261 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 VCPKMTQ9H867 229 aa21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 IGHA2P01877 340 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 GNAT2P19087 354 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 LPAR1Q92633 364 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 HMGCRP04035 888 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRIM32Q13049 653 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 SGPL1O95470 568 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 FSD1Q9BTV5 496 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 IGHDP01880 384 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 COG2Q14746 738 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 CAPN2P17655 700 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 DSG3P32926 999 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 SH2D4AQ9H788 454 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-202ENST00000373162 HOXC6P09630 235 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 CYP2B6P20813 491 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTPREP23469 700 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 TICAM2Q86XR7 235 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 EVI5LQ96CN4 794 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 APBA2Q99767 749 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 ALPK3Q96L96 1907 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYH4Q9Y623 1939 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 FRMPD3Q5JV73 1810 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCNA1P78396 465 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP2K5Q13163 448 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 GRB14Q14449 540 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCL14Q16627 93 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 HOXC10Q9NYD6 342 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 NYAP2Q9P242 653 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 RPTORQ8N122 1335 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 RGS2P41220 211 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 TDO2P48775 406 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 NUCB1Q02818 461 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 REPS2Q8NFH8 660 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATG4CQ96DT6 458 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 DEFB118Q96PH6 123 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 LNPKQ9C0E8 428 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 MB21D1Q8N884 522 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A0D9SFI3 127 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPARAQ07869 468 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 VPS53Q5VIR6 699 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 MKL1Q969V6 931 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRDM1O75626 825 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 ALX1Q15699 326 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.46■■□□□ 1.03
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