RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLFNL1Q499Z3 407 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRFN4Q6PJG9 635 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CREG2Q8IUH2 290 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GPR150Q8NGU9 434 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BSNDQ8WZ55 320 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZBTB9Q96C00 473 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NGLY1Q96IV0 654 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FANCD2OSQ96PS1 177 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADOQ96SZ5 270 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR18Q9BV38 432 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLHL14Q9P2G3 628 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHIC2Q9UKJ5 165 aa0.61□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MROH6A6NGR9 719 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRR33A8MZF0 331 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF81P51508 661 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ERVFRD-1P60508 538 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TROAPQ12815 778 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DUSP4Q13115 394 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAP7D1Q3KQU3 841 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLIP3Q96DZ5 547 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNMB2Q9Y691 235 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1B0GVY2 172 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NFKBIEO00221 500 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EOMESO95936 686 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 USP17L8P0C7I0 530 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PNLIPP16233 465 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SDHBP21912 280 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FHL1Q13642 323 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TTLL4Q14679 1199 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TTLL7Q6ZT98 887 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RD3Q7Z3Z2 195 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C1orf210Q8IVY1 113 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STAG2Q8N3U4 1231 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM34Q9BYJ4 488 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TXLNGQ9NUQ3 528 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CRCT1Q9UGL9 99 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAN1Q9Y2M0 1017 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRSS47A8MTI9 375 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EPHB4P54760 987 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ID3Q02535 119 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VAC14Q08AM6 782 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXF2Q12947 444 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AMHR2Q16671 573 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM26FQ5R3K3 315 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SFRP5Q5T4F7 317 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HDXQ7Z353 690 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RGL4Q8IZJ4 473 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EDAQ92838 391 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CORO1BQ9BR76 489 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DISC1Q9NRI5 854 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLFN14P0C7P3 912 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FGD1P98174 961 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 USPL1Q5W0Q7 1092 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLFN13Q68D06 897 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF778Q96MU6 729 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WACQ9BTA9 647 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 JADE2Q9NQC1 790 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MMP24Q9Y5R2 645 aa0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NOTOA8MTQ0 251 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B4GALT3O60512 393 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EGR3Q06889 387 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDE3AQ14432 1141 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAB3GAP1Q15042 981 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 P3H3Q8IVL6 736 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRT78Q8N1N4 520 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NELL1Q92832 810 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ISL2Q96A47 359 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RGMAQ96B86 450 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DZANK1Q9NVP4 752 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTMR4Q9NYA4 1195 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLK14Q9P0G3 267 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NRDCO43847 1150 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BMP15O95972 392 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP2CBP62714 309 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP2CAP67775 309 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms