RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.48■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 NUP58Q9BVL2 599 aa18.48■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 LZTFL1Q9NQ48 299 aa18.48■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 ZSWIM5Q9P217 1185 aa18.48■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 DNM3Q9UQ16 869 aa18.48■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 BACH1O14867 736 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 CETN3O15182 167 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 EPB41P11171 864 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 SELENOOQ9BVL4 669 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 IMPG2Q9BZV3 1241 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 RCOR1Q9UKL0 485 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 NCAPH2Q6IBW4 605 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 NEK8Q86SG6 692 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 ADRA2BP18089 450 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 KARSQ15046 597 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 TAX1BP1Q86VP1 789 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 PAF1Q8N7H5 531 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa18.47■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 ARID5AQ03989 594 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 USH1GQ495M9 461 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 TCHPQ9BT92 498 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 GUCA1BQ9UMX6 200 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 ZBED4O75132 1171 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 NDUFA8P51970 172 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF569Q5MCW4 686 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 GOLGA1Q92805 767 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.46■□□□□ 0.55
ITGA3-202ENST00000320031 CHMP2AO43633 222 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 INF2Q27J81 1249 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 NELFBQ8WX92 580 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 PSTPIP2Q9H939 334 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 MACROD2A1Z1Q3 448 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 OR52Z1P0C646 297 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 MECOMQ03112 1051 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 VWA3BQ502W6 1294 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGEF35A5YM69 484 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGAP6O43182 974 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 CFBP00751 764 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 ICA1Q05084 483 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 SYNE4Q8N205 404 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 CALUO43852 315 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 LONP1P36776 959 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 DRC1Q96MC2 740 aa18.45■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 STAMQ92783 540 aa18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 ANKRD62A6NC57 917 aa18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 RXRBP28702 533 aa18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 PKD2L1Q9P0L9 805 aa18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 RESTQ13127 1097 aa18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 PTGDRQ13258 359 aa18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 MRVI1Q9Y6F6 885 aa18.44■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 SMTNP53814 917 aa18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 BLZF1Q9H2G9 400 aa18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 TUBBP07437 444 aa18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 CLIC6Q96NY7 704 aa18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 MMP1P03956 469 aa18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 NPR1P16066 1061 aa18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 CTNNA2P26232 953 aa18.43■□□□□ 0.54
ITGA3-202ENST00000320031 DYMQ7RTS9 669 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms