RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 DPYDQ12882 1025 aa31.84■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 TMTC3Q6ZXV5 915 aa31.84■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 KCNQ4P56696 695 aa31.83■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 FAM193AP78312 1265 aa31.83■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 MAP3K9P80192 1104 aa31.83■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 CARD6Q9BX69 1037 aa31.83■■■□□ 2.69
UBP1-201ENST00000283628 CDKAL1Q5VV42 579 aa31.82■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 CERKQ8TCT0 537 aa31.82■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 PRDM1O75626 825 aa31.82■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 AFMP43652 599 aa31.82■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 TTC38Q5R3I4 469 aa31.82■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 TERF2Q15554 542 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 CTR9Q6PD62 1173 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 FHOD1Q9Y613 1164 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 SMIM22K7EJ46 135 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 ORC4O43929 436 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 CCDC175P0C221 793 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 TRAPPC10P48553 1259 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 NPY5RQ15761 445 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 PPFIBP1Q86W92 1011 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 WDR24Q96S15 920 aa31.8■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
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UBP1-201ENST00000283628 CD44P16070 742 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 PBX1P40424 430 aa31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 FILIP1LQ4L180 1135 aa31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 TMCO3Q6UWJ1 677 aa31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 MRFAP1Q9Y605 127 aa31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 CASZ1Q86V15 1759 aa31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 KIFC2Q96AC6 838 aa31.79■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
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UBP1-201ENST00000283628 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP31.78■■■□□ 2.68
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UBP1-201ENST00000283628 CREBRFQ8IUR6 639 aa31.78■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa31.77■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa31.77■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 ZNF174Q15697 407 aa31.77■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 IGSF22Q8N9C0 903 aa31.77■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 KLHL10Q6JEL2 608 aa31.77■■■□□ 2.68
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UBP1-201ENST00000283628 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 LY75O60449 1722 aa31.76■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 TEX33O43247 280 aa31.76■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 ATP8B1O43520 1251 aa31.76■■■□□ 2.68
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UBP1-201ENST00000283628 ZNF384Q8TF68 577 aa31.76■■■□□ 2.68
UBP1-201ENST00000283628 MINPP1Q9UNW1 487 aa31.76■■■□□ 2.68
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UBP1-201ENST00000283628 USP17L12C9JPN9 530 aa31.76■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 USP17L21D6R901 530 aa31.76■■■□□ 2.67
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UBP1-201ENST00000283628 ERFEQ4G0M1 354 aa31.76■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 CCDC51Q96ER9 411 aa31.76■■■□□ 2.67
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UBP1-201ENST00000283628 IGSF3O75054 1194 aa31.75■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 PPP2R3AQ06190 1150 aa31.75■■■□□ 2.67
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UBP1-201ENST00000283628 RBL2Q08999 1139 aa31.74■■■□□ 2.67
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UBP1-201ENST00000283628 FAM182BQ5T319 152 aa31.74■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
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UBP1-201ENST00000283628 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa31.73■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 MAST2Q6P0Q8 1798 aa31.73■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 MFAP3LO75121 409 aa31.72■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
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UBP1-201ENST00000283628 TAF1LQ8IZX4 1826 aa31.72■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 COL24A1Q17RW2 1714 aa31.72■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 SOWAHDA6NJG2 315 aa31.72■■■□□ 2.67
UBP1-201ENST00000283628 CASP1P29466 404 aa31.72■■■□□ 2.67
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