RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250066.6

USP6-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP6, Length 7,976 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6-201ENST00000250066 GNGT1P63211 74 aa9.51□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 LZICQ8WZA0 190 aa9.51□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 CDKL2Q92772 493 aa9.51□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.51□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MCF2P10911 925 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 BCAS4Q8TDM0 211 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TEX12Q9BXU0 123 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 RAD50Q92878 1312 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 A0A1B0GW55 424 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ABL1P00519 1130 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 DUX4Q9UBX2 424 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MAP3K7O43318 606 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 PLCG2P16885 1265 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ART3Q13508 389 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 NUMA1Q14980 2115 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 GNAT2P19087 354 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 IFNA8P32881 189 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 KRT4P19013 534 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ST7Q9NRC1 585 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TRPC6Q9Y210 931 aa9.5□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 SLFN5Q08AF3 891 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 GCNT3O95395 438 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 LETM2Q2VYF4 491 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ATL3Q6DD88 541 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 M0QZ92 97 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 INHBAP08476 426 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 PRPSAP1Q14558 356 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TTC22Q5TAA0 569 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 HIF1AQ16665 826 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ATG16L1Q676U5 607 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 SAR1BQ9Y6B6 198 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TMEM247A6NEH6 219 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 KRIT1O00522 736 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 SLC9A5Q14940 896 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MCUQ8NE86 351 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 GSDMAQ96QA5 445 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TTC1Q99614 292 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 A0A1B0GVL5 298 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MAGEA1P43355 309 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 KIF22Q14807 665 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 STK24Q9Y6E0 443 aa9.49□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.48□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 IL9RQ01113 521 aa9.48□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.48□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TAF11Q15544 211 aa9.48□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.48□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.48□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.48□□□□□ -0.89
USP6-201ENST00000250066 TCP11Q8WWU5 503 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms