RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nek1P51954 1203 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam198bQ3UPI1 517 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vps16Q920Q4 839 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Magi2Q9WVQ1 1275 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LtbrP50284 415 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbx2Q60707 711 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc9a1Q61165 820 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lca5Q80ST9 704 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nod2Q8K3Z0 1020 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gdf11Q9Z1W4 405 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klrc1Q9Z202 244 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nsrp1Q5NCR9 542 aa17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Panx2Q6IMP4 677 aa17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hps4Q99KG7 671 aa17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col2a1P28481 1487 aa17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Serpina16D3Z660 418 aa17.02■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pla2g4bP0C871 782 aa17.02■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Grm4Q68EF4 912 aa17.02■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hip1rQ9JKY5 1068 aa17.02■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Btaf1E9QAE3 1848 aa17.02■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d2B1AVH7 922 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zscan18E9PUD6 809 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 WaslQ91YD9 501 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdhd1P59328 1117 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eya3P97480 510 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 VrtnQ3SYK4 740 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Armc2Q3URY6 854 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cbx6Q9DBY5 414 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Itgb4A2A863 1818 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankk1Q8BZ25 745 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mtmr6Q8VE11 617 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A1L1SQF0 893 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp17lbE9Q9U0 468 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mboat4P0C7A3 435 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gcnt1Q09324 428 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clic6Q8BHB9 596 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Txnrd3Q99MD6 652 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr64Q9D565 1086 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Surf1P09925 306 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc51aQ8R000 340 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sgpp1Q9JI99 430 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A0U1RNP2 1173 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5134E9QAB5 671 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn2r68L7N2B3 851 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adssl1P28650 457 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sdc2P43407 202 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gja5Q01231 358 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankrd13aQ80UP5 588 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp646Q6NV66 1788 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il7P10168 154 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam178bQ24JP3 464 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Psg29Q3URN6 468 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5114W4VSN8 858 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Alppl2P24823 529 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tgs1Q923W1 853 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Brms1Q99N20 246 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lonrf3Q9D4H7 753 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sema3fO88632 785 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcna1P16388 495 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krt39Q6IFX4 482 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ParnQ8VDG3 624 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LpxnQ99N69 386 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myo1aO88329 1043 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccp110Q7TSH4 1004 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kctd3Q8BFX3 815 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim29Q8R2Q0 587 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dock2Q8C3J5 1828 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A1W2P6Q8 802 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A1W2P7Z8 802 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9046A0A1W2P855 802 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf568E9PYI1 671 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klhdc9Q3USL1 350 aa16.97■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm12b2Q66JV4 834 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sval3Q76I99 144 aa16.97■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.1 ms