RNA–Protein interactions for RNA: YPL119C

DBP1, Transcript of Putative ATP-dependent RNA helicase of the DEAD-box protein family, yeast

Gene DBP1, Length 1,854 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DBP1	YPL119C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	CTP1	P38152	299 aa		9.62	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	MRP21	P38175	177 aa		9.62	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	TSC10	P38342	320 aa		9.62	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	HFD1	Q04458	532 aa		9.62	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	HSF1	P10961	833 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	SEC15	P22224	910 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	MSH2	P25847	964 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	SIN4	P32259	974 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	SPR1	P32603	445 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	ADD66	P36040	267 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	POA1	P38218	177 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	AIF1	P52923	378 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	PNG1	Q02890	363 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	PIR3	Q03180	325 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	CRN1	Q06440	651 aa		9.61	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	9.6	□□□□□ -0.87	not detected
DBP1	YPL119C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	MEF1	P25039	761 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	FUI1	P38196	639 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	BZZ1	P38822	633 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	YHR131C	P38835	850 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	SEO1	P39709	593 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	MDJ2	P42834	146 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	BST1	P43571	1029 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	MIG2	P53035	382 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	RSC4	Q02206	625 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	YPL034W	Q03083	165 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	RPN4	Q03465	531 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	FAR10	Q06001	478 aa		9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	9.6	□□□□□ -0.87	not detected
DBP1	YPL119C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	9.6	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	BUD14	P27637	709 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	MET22	P32179	357 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	PTH2	P34222	208 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	YKR051W	P36142	418 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	JEM1	P40358	645 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	KTR7	P40504	517 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	SEC10	Q06245	871 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	BCP1	Q06338	283 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	LDB18	Q07887	179 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	NDJ1	Q12366	352 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	PGS1	P25578	521 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	HES1	P35843	434 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	ECM13	P38195	257 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	UFE1	P41834	346 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	YFL052W	P43551	465 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	COG2	P53271	262 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	COQ6	P53318	479 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	YNL058C	P53947	316 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	NUP100	Q02629	959 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	UBX3	Q12229	455 aa		9.59	□□□□□ -0.87
DBP1	YPL119C	PDE1	P22434	369 aa		9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	KTR4	P38131	464 aa		9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	YHL041W	P38730	149 aa		9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	VAC8	P39968	578 aa		9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	YIR016W	P40572	265 aa		9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	COS6	P53344	381 aa		9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	YCS4	Q06156	1176 aa		9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	MDY2	Q12285	212 aa		9.58	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	STE2	D6VTK4	431 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	CLN1	P20437	546 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	TFC3	P34111	1160 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	TFA2	P36145	328 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	CDC27	P38042	758 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	YIL001W	P40560	513 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	MRX6	P48564	524 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	NUP84	P52891	726 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	YNR063W	P53749	607 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	PET117	Q02771	107 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	RUP1	Q12242	671 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	YPL247C	Q12523	523 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	YJR061W	P40355	935 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	SAP4	P53036	818 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	PEX8	P53248	589 aa		9.57	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	NMT1	P14743	455 aa		9.56	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	9.56	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	9.56	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	RBK1	P25332	333 aa		9.56	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	YCR099C	P25657	155 aa		9.56	□□□□□ -0.88
DBP1	YPL119C	MNN1	P39106	762 aa		9.56	□□□□□ -0.88

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