RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 IRF6O14896 467 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 KDM4AO75164 1064 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 HSPA4P34932 840 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 VEGFBP49765 207 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 GTF2A2P52657 109 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 SPP2Q13103 211 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 SNAPC2Q13487 334 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 IQCA1Q86XH1 822 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 WDR18Q9BV38 432 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 SH2D4AQ9H788 454 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 GJA5P36382 358 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 STX8Q9UNK0 236 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 USP17L10C9JJH3 530 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 AOC2O75106 756 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 SEC24BO95487 1268 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 CETPP11597 493 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 GUCY1A2P33402 732 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 SREBF2Q12772 1141 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCL15Q16663 113 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 CEP95Q96GE4 821 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 KCNH4Q9UQ05 1017 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 TAF6LQ9Y6J9 622 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-209ENST00000566833 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 ERICH2A1L162 156 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 C19orf81C9J6K1 198 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 RAD21O60216 631 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 TTLL1O95922 423 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAP2K2P36507 400 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 USP14P54578 494 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 BACE1P56817 501 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 MTMR2Q13614 643 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 RASEFQ8IZ41 740 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 ACER1Q8TDN7 264 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 NEK1Q96PY6 1258 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 NYAP2Q9P242 653 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 NMT2O60551 498 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 PSMA5P28066 241 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 MCM5P33992 734 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 HMGCS2P54868 508 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 INHBEP58166 350 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 SNX14Q9Y5W7 946 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 KCNB2Q92953 911 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 GOPCQ9HD26 462 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMX2Q9Y320 296 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 TNKSO95271 1327 aa15.87■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 MYH4Q9Y623 1939 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 A0A1W2PRG0 241 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 PRC1O43663 620 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 CHST3Q7LGC8 479 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 TTC14Q96N46 770 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZIC5Q96T25 663 aa15.86■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 ANAPC15P60006 121 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 FGD1P98174 961 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 WTAPQ15007 396 aa15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1-209ENST00000566833 ADCK5Q3MIX3 580 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms