RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 CA12O43570 354 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D8O95759 1140 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 FEZ1Q99689 392 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOMM22Q9NS69 142 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALDH1A1P00352 501 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGRP09769 529 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 TFAP4Q01664 338 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 ICA1Q05084 483 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1W2PRG0 241 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPY3P0CV98 308 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPY8P0CW00 308 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 TREML2Q5T2D2 321 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP4K1Q92918 833 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 C19orf81C9J6K1 198 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDHXO00330 501 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 ORC4O43929 436 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP2B2Q01814 1243 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-208ENST00000566515 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 CRHR2Q13324 411 aa24.83■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.83■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.83■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.83■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.83■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 TSPY2A6NKD2 308 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEDD4P46934 1319 aa24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 LBX1P52954 281 aa24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP95Q96GE4 821 aa24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYH4Q9Y623 1939 aa24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP21A2P08686 494 aa24.8■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.8■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP14P54578 494 aa24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMX2Q9Y320 296 aa24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 NMT2O60551 498 aa24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP2C8P10632 490 aa24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH2D4AQ9H788 454 aa24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 NYAP2Q9P242 653 aa24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 C12orf42Q96LP6 360 aa24.77■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.77■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.77■■□□□ 1.56
CCNDBP1-208ENST00000566515 B4E1Z4 1266 aa24.76■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 ESR2Q92731 530 aa24.76■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTLL1O95922 423 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 VCAM1P19320 739 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR25O00155 361 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAD21O60216 631 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 KDM4AO75164 1064 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.553e-14■□□□□ 8.1
CCNDBP1-208ENST00000566515 NECTIN1Q15223 517 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 VCPKMTQ9H867 229 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 TLR2O60603 784 aa24.74■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CCNDBP1-208ENST00000566515 KRT23Q9C075 422 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms