RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.75■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.75■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 PSMC4P43686 418 aa23.75■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 FCGRTP55899 365 aa23.75■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 EVX2Q03828 476 aa23.75■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.75■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.75■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.75■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 SEPT2Q15019 361 aa23.74■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 SH2D4AQ9H788 454 aa23.74■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.73■■□□□ 1.39
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CMTM3-211ENST00000565922 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.73■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.73■■□□□ 1.39
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CMTM3-211ENST00000565922 GUCY1A2P33402 732 aa23.72■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 CAP1Q01518 475 aa23.72■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 NBPF11Q86T75 865 aa23.72■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.72■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.72■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 NAPBQ9H115 298 aa23.72■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 AKR1B1P15121 316 aa23.71■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 ICA1Q05084 483 aa23.71■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 RILPL2Q969X0 211 aa23.71■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 TRIM47Q96LD4 638 aa23.71■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.71■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 SRRDQ9UH36 339 aa23.71■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 MYH4Q9Y623 1939 aa23.71■■□□□ 1.39
CMTM3-211ENST00000565922 MYPNQ86TC9 1320 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L15C9J2P7 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L11C9JVI0 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L18D6R9N7 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L22D6RA61 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L19D6RCP7 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L20D6RJB6 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 USP17L24Q0WX57 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 ACER1Q8TDN7 264 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.7■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 VCAM1P19320 739 aa23.69■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 HERVK_113P62684 666 aa23.69■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 ARMC5Q96C12 935 aa23.69■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.69■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
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CMTM3-211ENST00000565922 CTGFP29279 349 aa23.68■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.68■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 LPAR1Q92633 364 aa23.68■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 COA7Q96BR5 231 aa23.68■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.68■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 SMIM22K7EJ46 135 aa23.67■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 RGS19P49795 217 aa23.67■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 PDE4BQ07343 736 aa23.67■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 RAET1EQ8TD07 263 aa23.67■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 PARP14Q460N5 1801 aa23.66■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 HIP1O00291 1037 aa23.66■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.66■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.66■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 TMX2Q9Y320 296 aa23.66■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 A0A1W2PRG0 241 aa23.65■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 RASA1P20936 1047 aa23.65■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 SOX10P56693 466 aa23.65■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 PPARAQ07869 468 aa23.65■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.65■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 FAM227BQ96M60 508 aa23.65■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CMTM3-211ENST00000565922 A0A0D9SFI3 127 aa23.64■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.64■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 VCPKMTQ9H867 229 aa23.64■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 GOPCQ9HD26 462 aa23.64■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 HTTP42858 3142 aa23.64■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 RLFQ13129 1914 aa23.63■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 SDSP20132 328 aa23.63■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 ATP2B2Q01814 1243 aa23.63■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 PRKCZQ05513 592 aa23.63■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 LBX2Q6XYB7 198 aa23.63■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF333Q96JL9 665 aa23.63■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.63■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 ZMYM6O95789 1325 aa23.62■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.62■■□□□ 1.37
CMTM3-211ENST00000565922 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.62■■□□□ 1.37
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