RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.06□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 PF4P02776 101 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 PKN1Q16512 942 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 KSR1Q8IVT5 923 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 FAM13CQ8NE31 585 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 KIRREL1Q96J84 757 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 FAM84AQ96KN4 292 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 TMEM74Q96NL1 305 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.05□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 GLI1P08151 1106 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 MPP2Q14168 576 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 Q96M66 194 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 BCL11AQ9H165 835 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.04□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.03□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 F13A1P00488 732 aa6.03□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 RAC2P15153 192 aa6.03□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 RNF141Q8WVD5 230 aa6.03□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.03□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.03□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.03□□□□□ -1.44
RRN3-204ENST00000561685 ESR1P03372 595 aa6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 MLANAQ16655 118 aa6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 FYB2Q5VWT5 728 aa6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.02□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 DBX1A6NMT0 343 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 SRFP11831 508 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 MESP2Q0VG99 397 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 MLECQ14165 292 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 GAB4Q2WGN9 574 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 REC114Q7Z4M0 266 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 ASPNQ9BXN1 380 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.01□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 UPK3BL1B0FP48 263 aa6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 F6X3S4 739 aa6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 HTR3BO95264 441 aa6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 TNNI2P48788 182 aa6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 TTC6Q86TZ1 520 aa6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 CREG2Q8IUH2 290 aa6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 DUSP13Q9UII6 198 aa6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.99□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 ZNF124Q15973 351 aa5.99□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 LRRC3Q9BY71 257 aa5.99□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.99□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 KBTBD4Q9NVX7 518 aa5.99□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 KLHL3Q9UH77 587 aa5.99□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 GRIN3BO60391 1043 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 TSPAN15O95858 294 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 HPXP02790 462 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 GARTP22102 1010 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 CHMP4BP1P59074 171 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 RALGPS1Q5JS13 557 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 ABHD4Q8TB40 342 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.97□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa5.97□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 LTKP29376 864 aa5.97□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 EGR3Q06889 387 aa5.97□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.97□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5.97□□□□□ -1.45
RRN3-204ENST00000561685 MYLIPQ8WY64 445 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms