RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538093.1

PLCD3-201, Transcript of phospholipase C delta 3, humanhuman

TSL 4

Gene PLCD3, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCD3-201ENST00000538093 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PLCD3-201ENST00000538093 VPS53Q5VIR6 699 aa22.83■■□□□ 1.25
PLCD3-201ENST00000538093 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.83■■□□□ 1.25
PLCD3-201ENST00000538093 FEZ1Q99689 392 aa22.83■■□□□ 1.25
PLCD3-201ENST00000538093 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.83■■□□□ 1.25
PLCD3-201ENST00000538093 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 A0A1W2PRG0 241 aa22.81■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 OSBPP22059 807 aa22.81■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.81■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 PEX10O60683 326 aa22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 SDSP20132 328 aa22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 KIF22Q14807 665 aa22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 NAPBQ9H115 298 aa22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 PNMA3Q9UL41 463 aa22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.8■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 MGAMO43451 1857 aa22.79■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.79■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 PRDM1O75626 825 aa22.79■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 PSMC4P43686 418 aa22.79■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.79■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 TRIM47Q96LD4 638 aa22.79■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 CCDC17Q96LX7 622 aa22.79■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.79■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 RASA1P20936 1047 aa22.78■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.78■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.78■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 ATP2B2Q01814 1243 aa22.77■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.77■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 C12orf42Q96LP6 360 aa22.77■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 INCENPQ9NQS7 918 aa22.77■■□□□ 1.24
PLCD3-201ENST00000538093 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.76■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 USP14P54578 494 aa22.76■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 ICA1Q05084 483 aa22.76■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.76■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 PPARAQ07869 468 aa22.76■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 ARHGEF6Q15052 776 aa22.76■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 TTC22Q5TAA0 569 aa22.76■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.76■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 VCAM1P19320 739 aa22.75■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.75■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 SKAP1Q86WV1 359 aa22.75■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.75■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 HERVK_113P62684 666 aa22.74■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 TICAM2Q86XR7 235 aa22.74■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.74■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 USP17L15C9J2P7 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 USP17L11C9JVI0 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 USP17L18D6R9N7 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 USP17L22D6RA61 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 USP17L19D6RCP7 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 USP17L20D6RJB6 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 FGAP02671 866 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 USP17L24Q0WX57 530 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 TMX2Q9Y320 296 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 HTTP42858 3142 aa22.73■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 FCGRTP55899 365 aa22.72■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 SOX10P56693 466 aa22.72■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 ALX1Q15699 326 aa22.72■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.72■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.72■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.72■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.72■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.72■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 SRRDQ9UH36 339 aa22.72■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 GABRQQ9UN88 632 aa22.72■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 Q3C1V9 767 aa22.71■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.71■■□□□ 1.23
PLCD3-201ENST00000538093 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PLCD3-201ENST00000538093 PRKCZQ05513 592 aa22.7■■□□□ 1.22
PLCD3-201ENST00000538093 PDE4BQ07343 736 aa22.7■■□□□ 1.22
PLCD3-201ENST00000538093 IL25Q9H293 177 aa22.7■■□□□ 1.22
PLCD3-201ENST00000538093 VCPKMTQ9H867 229 aa22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms