RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514514.5

PAIP1-208, Transcript of poly(A) binding protein interacting protein 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PAIP1, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAIP1-208	ENST00000514514	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	CDKL5	O76039	1030 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	TNNI2	P48788	182 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	TNFAIP1	Q13829	316 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	STX8	Q9UNK0	236 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	KIF3A	Q9Y496	699 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	GRIN3B	O60391	1043 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	PNMA1	Q8ND90	353 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	MTMR6	Q9Y217	621 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	PPFIA3	O75145	1194 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	EPS15	P42566	896 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	HACL1	Q9UJ83	578 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	IFNAR1	P17181	557 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	RASA3	Q14644	834 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	MAP3K14	Q99558	947 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	28.03	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	STK36	Q9NRP7	1315 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PAIP1-208	ENST00000514514	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	TBC1D12	O60347	775 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	NFKBIB	Q15653	356 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	PHKB	Q93100	1093 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	TEPSIN	Q96N21	525 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	NBPF11	Q86T75	865 aa		28	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	GRM4	Q14833	912 aa		28	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		28	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	TTLL1	O95922	423 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	MAP3K10	Q02779	954 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	MYH4	Q9Y623	1939 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	F13A1	P00488	732 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	KIF5B	P33176	963 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	FUT2	Q10981	343 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	GBP4	Q96PP9	640 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	GDF11	O95390	407 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	GUCY1A2	P33402	732 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	UTRN	P46939	3433 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	MYH6	P13533	1939 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514		H3BQV1	296 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	JAG1	P78504	1218 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	IFFO2	Q5TF58	517 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	GGA3	Q9NZ52	723 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PAIP1-208	ENST00000514514	FOSB	P53539	338 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PAIP1-208	ENST00000514514	SEPT2	Q15019	361 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PAIP1-208	ENST00000514514	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PAIP1-208	ENST00000514514	RGS22	Q8NE09	1264 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PAIP1-208	ENST00000514514	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PAIP1-208	ENST00000514514	NYAP2	Q9P242	653 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PAIP1-208	ENST00000514514	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PAIP1-208	ENST00000514514	GH2	P01242	217 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PAIP1-208	ENST00000514514	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06

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