RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511338.1

SEC31A-232, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 5

Gene SEC31A, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-232ENST00000511338 A0A1W2PQU0 124 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 ECEL1O95672 775 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 NAT2P11245 290 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 RAG1P15918 1043 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 ADH7P40394 386 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 GUCY2FP51841 1108 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 POU4F3Q15319 338 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 BBS9Q3SYG4 887 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 FOXR1Q6PIV2 292 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 RELTQ969Z4 430 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.85□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 PGRP06401 933 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 BMP4P12644 408 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 CPEP16870 476 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 MAOBP27338 520 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 GRK4P32298 578 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 ARL4DP49703 201 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 PDE3AQ14432 1141 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 PPP2R5AQ15172 486 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 PODNQ7Z5L7 613 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 ACDQ96AP0 544 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.84□□□□□ -1.47
SEC31A-232ENST00000511338 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 GPR25O00155 361 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 KIF3BO15066 747 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 TSPAN6O43657 245 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 ZNF862O60290 1169 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 ARAFP10398 606 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 SDSP20132 328 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 RHBDL3P58872 404 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 PIP4K2BP78356 416 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 SCUBE1Q8IWY4 988 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 RIN3Q8TB24 985 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 TTC9Q92623 222 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.83□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 C2CD2LO14523 706 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 KATNA1O75449 491 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 RASGRP1O95267 797 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 LIG1P18858 919 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 PPP2R2AP63151 447 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 MAP7Q14244 749 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 C12orf40Q86WS4 652 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 SMC5Q8IY18 1101 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 FAM13CQ8NE31 585 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 WNT8BQ93098 351 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 SLC6A18Q96N87 628 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 APBA2Q99767 749 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 CSADQ9Y600 493 aa5.82□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 OIP5O43482 229 aa5.81□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 EYA4O95677 639 aa5.81□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 EPHX1P07099 455 aa5.81□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 GNALP38405 381 aa5.81□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 MCL1Q07820 350 aa5.81□□□□□ -1.48
SEC31A-232ENST00000511338 BIRC2Q13490 618 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms